RFC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EBU, 2K6G, 2K7F

Ідентифікатори

Символи

RFC1, RFC, replication factor C subunit 1, A1, PO-GA, RECC1, MHCBFB, RFC140, CANVAS

Зовнішні ІД

OMIM: 102579 MGI: 97891 HomoloGene: 2187 GeneCards: RFC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0010577 enzyme activator activity • ATP binding • DNA clamp loader activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • double-stranded DNA binding • protein domain specific binding • DNA clamp unloader activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • екзосома • DNA replication factor C complex • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма • Elg1 RFC-like complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • telomere maintenance via telomerase • error-free translesion synthesis • transcription, DNA-templated • error-prone translesion synthesis • реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA clamp unloading
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5981


19687

Ensembl


ENSG00000035928


ENSMUSG00000029191

UniProt


P35251


P35601

RefSeq (мРНК)


NM_001204747 NM_002913 NM_001363495 NM_001363496


NM_011258 NM_001347357 NM_001347358

RefSeq (білок)


NP_001191676 NP_002904 NP_001350424 NP_001350425


NP_001334286 NP_001334287 NP_035388

Локус (UCSC)

Хр. 4: 39.29 – 39.37 Mb

Хр. 5: 65.42 – 65.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RFC1 (англ. Replication factor C subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 128 255^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDIRKFFGVI	PSGKKLVSET	VKKNEKTKSD	EETLKAKKGI	KEIKVNSSRK
EDDFKQKQPS	KKKRIIYDSD	SESEETLQVK	NAKKPPEKLP	VSSKPGKISR
QDPVTYISET	DEEDDFMCKK	AASKSKENGR	STNSHLGTSN	MKKNEENTKT
KNKPLSPIKL	TPTSVLDYFG	TGSVQRSNKK	MVASKRKELS	QNTDESGLND
EAIAKQLQLD	EDAELERQLH	EDEEFARTLA	MLDEEPKTKK	ARKDTEAGET
FSSVQANLSK	AEKHKYPHKV	KTAQVSDERK	SYSPRKQSKY	ESSKESQQHS
KSSADKIGEV	SSPKASSKLA	IMKRKEESSY	KEIEPVASKR	KENAIKLKGE
TKTPKKTKSS	PAKKESVSPE	DSEKKRTNYQ	AYRSYLNREG	PKALGSKEIP
KGAENCLEGL	IFVITGVLES	IERDEAKSLI	ERYGGKVTGN	VSKKTNYLVM
GRDSGQSKSD	KAAALGTKII	DEDGLLNLIR	TMPGKKSKYE	IAVETEMKKE
SKLERTPQKN	VQGKRKISPS	KKESESKKSR	PTSKRDSLAK	TIKKETDVFW
KSLDFKEQVA	EETSGDSKAR	NLADDSSENK	VENLLWVDKY	KPTSLKTIIG
QQGDQSCANK	LLRWLRNWQK	SSSEDKKHAA	KFGKFSGKDD	GSSFKAALLS
GPPGVGKTTT	ASLVCQELGY	SYVELNASDT	RSKSSLKAIV	AESLNNTSIK
GFYSNGAASS	VSTKHALIMD	EVDGMAGNED	RGGIQELIGL	IKHTKIPIIC
MCNDRNHPKI	RSLVHYCFDL	RFQRPRVEQI	KGAMMSIAFK	EGLKIPPPAM
NEIILGANQD	IRQVLHNLSM	WCARSKALTY	DQAKADSHRA	KKDIKMGPFD
VARKVFAAGE	ETAHMSLVDK	SDLFFHDYSI	APLFVQENYI	HVKPVAAGGD
MKKHLMLLSR	AADSICDGDL	VDSQIRSKQN	WSLLPAQAIY	ASVLPGELMR
GYMTQFPTFP	SWLGKHSSTG	KHDRIVQDLA	LHMSLRTYSS	KRTVNMDYLS
LLRDALVQPL	TSQGVDGVQD	VVALMDTYYL	MKEDFENIME	ISSWGGKPSP
FSKLDPKVKA	AFTRAYNKEA	HLTPYSLQAI	KASRHSTSPS	LDSEYNEELN
EDDSQSDEKD	QDAIETDAMI	KKKTKSSKPS	KPEKDKEPRK	GKGKSSKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Bunz F., Kobayashi R., Stillman B. (1993). cDNAs encoding the large subunit of human replication factor C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11014—11018. PMID 8248204 DOI:10.1073/pnas.90.23.11014
Lu Y., Zeft A.S., Riegel A.T. (1993). Cloning and expression of a novel human DNA binding protein, PO-GA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 193: 779—786. PMID 8512577 DOI:10.1006/bbrc.1993.1693
Lu Y., Riegel A.T. (1994). The human DNA-binding protein, PO-GA, is homologous to the large subunit of mouse replication factor C: regulation by alternate 3' processing of mRNA. Gene. 145: 261—265. PMID 7914507 DOI:10.1016/0378-1119(94)90017-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mossi R., Jonsson Z.O., Allen B.L., Hardin S.H., Huebscher U. (1997). Replication factor C interacts with the C-terminal side of proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 272: 1769—1776. PMID 8999859 DOI:10.1074/jbc.272.3.1769
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9969 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35251 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.