RHOBTB1

Ідентифікатори

Символи

RHOBTB1, Rho related BTB domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607351 MGI: 1916538 HomoloGene: 8892 GeneCards: RHOBTB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity • protein kinase binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • цитоплазма • цитоскелет • cell projection
Біологічний процес	• regulation of small GTPase mediated signal transduction • small GTPase mediated signal transduction • GO:0000767 cell morphogenesis • actin filament organization • Rho protein signal transduction • cell migration • actin cytoskeleton organization • positive regulation of actin filament polymerization • actin cytoskeleton reorganization • engulfment of apoptotic cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9886


69288

Ensembl


ENSG00000072422


ENSMUSG00000019944

UniProt


O94844


Q9DAK3

RefSeq (мРНК)

NM_001242359 NM_014836 NM_001350902 NM_001350903 NM_001350904
NM_001350905 NM_001350906 NM_001350907 NM_001350908 NM_001350909 NM_001350910 NM_001350911


NM_001081347 NM_001252636 NM_001252637 NM_001252638

RefSeq (білок)

NP_001229288 NP_055651 NP_001337831 NP_001337832 NP_001337833
NP_001337834 NP_001337835 NP_001337836 NP_001337837 NP_001337838 NP_001337839 NP_001337840 NP_001229288.1 NP_055651.1


NP_001074816 NP_001239565 NP_001239566 NP_001239567

Локус (UCSC)

Хр. 10: 60.87 – 61 Mb

Хр. 10: 68.99 – 69.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RHOBTB1 (англ. Rho related BTB domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 696 амінокислот, а молекулярна маса — 79 417^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDADMDYERP	NVETIKCVVV	GDNAVGKTRL	ICARACNTTL	TQYQLLATHV
PTVWAIDQYR	VCQEVLERSR	DVVDEVSVSL	RLWDTFGDHH	KDRRFAYGRS
DVVVLCFSIA	NPNSLNHVKS	MWYPEIKHFC	PRTPVILVGC	QLDLRYADLE
AVNRARRPLA	RPIKRGDILP	PEKGREVAKE	LGLPYYETSV	FDQFGIKDVF
DNAIRAALIS	RRHLQFWKSH	LKKVQKPLLQ	APFLPPKAPP	PVIKIPECPS
MGTNEAACLL	DNPLCADVLF	ILQDQEHIFA	HRIYLATSSS	KFYDLFLMEC
EESPNGSEGA	CEKEKQSRDF	QGRILSVDPE	EEREEGPPRI	PQADQWKSSN
KSLVEALGLE	AEGAVPETQT	LTGWSKGFIG	MHREMQVNPI	SKRMGPMTVV
RMDASVQPGP	FRTLLQFLYT	GQLDEKEKDL	VGLAQIAEVL	EMFDLRMMVE
NIMNKEAFMN	QEITKAFHVR	KANRIKECLS	KGTFSDVTFK	LDDGAISAHK
PLLICSCEWM	AAMFGGSFVE	SANSEVYLPN	INKISMQAVL	DYLYTKQLSP
NLDLDPLELI	ALANRFCLPH	LVALAEQHAV	QELTKAATSG	VGIDGEVLSY
LELAQFHNAH	QLAAWCLHHI	CTNYNSVCSK	FRKEIKSKSA	DNQEYFERHR
WPPVWYLKEE	DHYQRVKRER	EKEDIALNKH	RSRRKWCFWN	SSPAVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

Ramos S., Khademi F., Somesh B.P., Rivero F. (2002). Genomic organization and expression profile of the small GTPases of the RhoBTB family in human and mouse. Gene. 298: 147—157. PMID 12426103 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00980-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18738 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O94844 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.