RNASE6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4X09

Ідентифікатори

Символи

RNASE6, RAD1, RNS6, RNasek6, ribonuclease A family member k6

Зовнішні ІД

OMIM: 601981 MGI: 1925666 HomoloGene: 4102 GeneCards: RNASE6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • ribonuclease activity
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • лізосома
Біологічний процес	• defense response • Деградація РНК • antimicrobial humoral response • antibacterial humoral response • вроджений імунітет • defense response to virus • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • RNA phosphodiester bond hydrolysis • defense response to bacterium • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6039


78416

Ensembl


ENSG00000169413


ENSMUSG00000021880

UniProt


Q93091 Q6IB39


Q9D244

RefSeq (мРНК)


NM_005615


NM_030098 NM_001360117

RefSeq (білок)


NP_005606 NP_005606.1


NP_084374 NP_001347046

Локус (UCSC)

Хр. 14: 20.78 – 20.78 Mb

Хр. 14: 51.36 – 51.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNASE6 (англ. Ribonuclease A family member k6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот, а молекулярна маса — 17 196^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLCFPLLLL	LLVLWGPVCP	LHAWPKRLTK	AHWFEIQHIQ	PSPLQCNRAM
SGINNYTQHC	KHQNTFLHDS	FQNVAAVCDL	LSIVCKNRRH	NCHQSSKPVN
MTDCRLTSGK	YPQCRYSAAA	QYKFFIVACD	PPQKSDPPYK	LVPVHLDSIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Секретований назовні.

Література

Rosenberg H.F., Dyer K.D. (1996). Molecular cloning and characterization of a novel human ribonuclease (RNase k6): increasing diversity in the enlarging ribonuclease gene family. Nucleic Acids Res. 24: 3507—3513. PMID 8836175 DOI:10.1093/nar/24.18.3507
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10048 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q93091 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.