RNF11

Ідентифікатори

Символи

RNF11, SID1669, CGI-123, ring finger protein 11

Зовнішні ІД

OMIM: 612598 MGI: 1352759 HomoloGene: 32195 GeneCards: RNF11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• ubiquitin ligase complex • цитоплазма • recycling endosome • ендосома • early endosome • екзосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26994


29864

Ensembl


ENSG00000123091


ENSMUSG00000028557

UniProt


Q9Y3C5


Q9QYK7

RefSeq (мРНК)


NM_014372


NM_013876

RefSeq (білок)


NP_055187


NP_038904

Локус (UCSC)

Хр. 1: 51.24 – 51.27 Mb

Хр. 4: 109.31 – 109.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF11 (англ. Ring finger protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 154 амінокислот, а молекулярна маса — 17 444^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNCLKSPTS	DDISLLHESQ	SDRASFGEGT	EPDQEPPPPY	QEQVPVPVYH
PTPSQTRLAT	QLTEEEQIRI	AQRIGLIQHL	PKGVYDPGRD	GSEKKIRECV
ICMMDFVYGD	PIRFLPCMHI	YHLDCIDDWL	MRSFTCPSCM	EPVDAALLSS
YETN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Connor M.K., Azmi P.B., Subramaniam V., Li H., Seth A.K. (2005). Molecular characterization of ring finger protein 11. Mol. Cancer Res. 3: 453—461. PMID 16123141 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-04-0166
Li H., Seth A.K. (2004). An RNF11: Smurf2 complex mediates ubiquitination of the AMSH protein. Oncogene. 23: 1801—1808. PMID 14755250 DOI:10.1038/sj.onc.1207319
Shembade N., Parvatiyar K., Harhaj N.S., Harhaj E.W. (2009). The ubiquitin-editing enzyme A20 requires RNF11 to downregulate NF-kappaB signalling. EMBO J. 28: 513—522. PMID 19131965 DOI:10.1038/emboj.2008.285
Scheper J., Oliva B., Villa-Freixa J., Thomson T.M. (2009). Analysis of electrostatic contributions to the selectivity of interactions between RING-finger domains and ubiquitin-conjugating enzymes. Proteins. 74: 92—103. PMID 18615712 DOI:10.1002/prot.22120

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10056 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3C5 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.