RNF13

Ідентифікатори

Символи

RNF13, RZF, ring finger protein 13, EIEE73, DEE73

Зовнішні ІД

OMIM: 609247 MGI: 1346341 HomoloGene: 13493 GeneCards: RNF13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • lysosomal membrane • Golgi membrane • nuclear inner membrane • ендосома • лізосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • late endosome membrane • клітинне ядро • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11342


24017

Ensembl


ENSG00000082996


ENSMUSG00000036503

UniProt


O43567


O54965

RefSeq (мРНК)

NM_007282 NM_183381 NM_183382 NM_183383 NM_183384
NM_001378285 NM_001378286 NM_001378287 NM_001378288 NM_001378289 NM_001378290 NM_001378291


NM_001113413 NM_011883 NM_001304454 NM_001304456 NM_001357080

RefSeq (білок)

NP_009213 NP_899237 NP_899239 NP_001365214 NP_001365215
NP_001365216 NP_001365217 NP_001365218 NP_001365219 NP_001365220


NP_001106884 NP_001291383 NP_001291385 NP_036013 NP_001344009

Локус (UCSC)

Хр. 3: 149.81 – 149.96 Mb

Хр. 3: 57.64 – 57.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF13 (англ. Ring finger protein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 42 814^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLSIGMLML	SATQVYTILT	VQLFAFLNLL	PVEADILAYN	FENASQTFDD
LPARFGYRLP	AEGLKGFLIN	SKPENACEPI	VPPPVKDNSS	GTFIVLIRRL
DCNFDIKVLN	AQRAGYKAAI	VHNVDSDDLI	SMGSNDIEVL	KKIDIPSVFI
GESSANSLKD	EFTYEKGGHL	ILVPEFSLPL	EYYLIPFLII	VGICLILIVI
FMITKFVQDR	HRARRNRLRK	DQLKKLPVHK	FKKGDEYDVC	AICLDEYEDG
DKLRILPCSH	AYHCKCVDPW	LTKTKKTCPV	CKQKVVPSQG	DSDSDTDSSQ
EENEVTEHTP	LLRPLASVSA	QSFGALSESR	SHQNMTESSD	YEEDDNEDTD
SSDAENEINE	HDVVVQLQPN	GERDYNIANT	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Q., Meng Y., Zhang L., Chen J., Zhu D. (2009). RNF13: a novel RING-type ubiquitin ligase over-expressed in pancreatic cancer. Cell Res. 19: 348—357. PMID 18794910 DOI:10.1038/cr.2008.285
Lomax M.I., Warner S.J., Bersirli C.G., Gong T.-W.L. (1998). The gene for a RING zinc finger protein is expressed in the inner chick ear after noise exposure. Prim. Sens. Neuron. 2: 305—316.

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10057 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O43567 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.