RNF13 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RNF13, RZF, ring finger protein 13, EIEE73, DEE73 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609247 MGI: 1346341 HomoloGene: 13493 GeneCards: RNF13 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • lysosomal membrane • Golgi membrane • nuclear inner membrane • ендосома • лізосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • late endosome membrane • клітинне ядро • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_007282 NM_183381 NM_183382 NM_183383 NM_183384
| NM_001378285 NM_001378286 NM_001378287 NM_001378288 NM_001378289 NM_001378290 NM_001378291 |
| | NM_001113413 NM_011883 NM_001304454 NM_001304456 NM_001357080 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_009213 NP_899237 NP_899239 NP_001365214 NP_001365215
| NP_001365216 NP_001365217 NP_001365218 NP_001365219 NP_001365220 |
| | NP_001106884 NP_001291383 NP_001291385 NP_036013 NP_001344009 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 149.81 – 149.96 Mb | Хр. 3: 57.64 – 57.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RNF13 (англ. Ring finger protein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 42 814[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLLSIGMLML | | SATQVYTILT | | VQLFAFLNLL | | PVEADILAYN | | FENASQTFDD |
LPARFGYRLP | | AEGLKGFLIN | | SKPENACEPI | | VPPPVKDNSS | | GTFIVLIRRL |
DCNFDIKVLN | | AQRAGYKAAI | | VHNVDSDDLI | | SMGSNDIEVL | | KKIDIPSVFI |
GESSANSLKD | | EFTYEKGGHL | | ILVPEFSLPL | | EYYLIPFLII | | VGICLILIVI |
FMITKFVQDR | | HRARRNRLRK | | DQLKKLPVHK | | FKKGDEYDVC | | AICLDEYEDG |
DKLRILPCSH | | AYHCKCVDPW | | LTKTKKTCPV | | CKQKVVPSQG | | DSDSDTDSSQ |
EENEVTEHTP | | LLRPLASVSA | | QSFGALSESR | | SHQNMTESSD | | YEEDDNEDTD |
SSDAENEINE | | HDVVVQLQPN | | GERDYNIANT | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Q., Meng Y., Zhang L., Chen J., Zhu D. (2009). RNF13: a novel RING-type ubiquitin ligase over-expressed in pancreatic cancer. Cell Res. 19: 348—357. PMID 18794910 DOI:10.1038/cr.2008.285
- Lomax M.I., Warner S.J., Bersirli C.G., Gong T.-W.L. (1998). The gene for a RING zinc finger protein is expressed in the inner chick ear after noise exposure. Prim. Sens. Neuron. 2: 305—316.
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10057 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O43567 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |