RP1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RP1, DCDC4A, Oretinitis pigmentosa 1 (autosomal dominant), axonemal microtubule associated, RP1 axonemal microtubule associated |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603937 MGI: 1341105 HomoloGene: 4564 GeneCards: RP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • photoreceptor outer segment • війка • мікротрубочка • цитоскелет • photoreceptor inner segment • microtubule associated complex • GO:0035085 Аксонема • photoreceptor connecting cilium • ciliary tip |
---|
Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction • відповідь на стимул • photoreceptor cell development • cell projection organization • phototransduction, visible light • зір • axoneme assembly • photoreceptor cell outer segment organization • photoreceptor cell maintenance • retinal rod cell development • retinal cone cell development • retina development in camera-type eye • retina morphogenesis in camera-type eye • cellular response to light stimulus • positive regulation of non-motile cilium assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/44/PBB_GE_RP1_gnf1h00088_at_fs.png/250px-PBB_GE_RP1_gnf1h00088_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001195662 NM_011283 NM_001370921 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001182591 NP_035413 NP_001357850 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 54.51 – 54.87 Mb | Хр. 1: 4.07 – 4.48 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RP1 (англ. RP1, axonemal microtubule associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 156 амінокислот, а молекулярна маса — 240 661[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSDTPSTGFS | | IIHPTSSEGQ | | VPPPRHLSLT | | HPVVAKRISF | | YKSGDPQFGG |
VRVVVNPRSF | | KSFDALLDNL | | SRKVPLPFGV | | RNISTPRGRH | | SITRLEELED |
GESYLCSHGR | | KVQPVDLDKA | | RRRPRPWLSS | | RAISAHSPPH | | PVAVAAPGMP |
RPPRSLVVFR | | NGDPKTRRAV | | LLSRRVTQSF | | EAFLQHLTEV | | MQRPVVKLYA |
TDGRRVPSLQ | | AVILSSGAVV | | AAGREPFKPG | | NYDIQKYLLP | | ARLPGISQRV |
YPKGNAKSES | | RKISTHMSSS | | SRSQIYSVSS | | EKTHNNDCYL | | DYSFVPEKYL |
ALEKNDSQNL | | PIYPSEDDIE | | KSIIFNQDGT | | MTVEMKVRFR | | IKEEETIKWT |
TTVSKTGPSN | | NDEKSEMSFP | | GRTESRSSGL | | KLAACSFSAD | | VSPMERSSNQ |
EGSLAEEINI | | QMTDQVAETC | | SSASWENATV | | DTDIIQGTQD | | QAKHRFYRPP |
TPGLRRVRQK | | KSVIGSVTLV | | SETEVQEKMI | | GQFSYSEERE | | SGENKSEYHM |
FTHSCSKMSS | | VSNKPVLVQI | | NNNDQMEESS | | LERKKENSLL | | KSSAISAGVI |
EITSQKMLEM | | SHNNGLPSTI | | SNNSIVEEDV | | VDCVVLDNKT | | GIKNFKTYGN |
TNDRFSPISA | | DATHFSSNNS | | GTDKNISEAP | | ASEASSTVTA | | RIDRLINEFA |
QCGLTKLPKN | | EKKILSSVAS | | KKKKKSRQQA | | INSRYQDGQL | | ATKGILNKNE |
RINTKGRITK | | EMIVQDSDSP | | LKGGILCEED | | LQKSDTVIES | | NTFCSKSNLN |
STISKNFHRN | | KLNTTQNSKV | | QGLLTKRKSR | | SLNKISLGAP | | KKREIGQRDK |
VFPHNESKYC | | KSTFENKSLF | | HVFNILEQKP | | KDFYAPQSQA | | EVASGYLRGM |
AKKSLVSKVT | | DSHITLKSQK | | KRKGDKVKAS | | AILSKQHATT | | RANSLASLKK |
PDFPEAIAHH | | SIQNYIQSWL | | QNINPYPTLK | | PIKSAPVCRN | | ETSVVNCSNN |
SFSGNDPHTN | | SGKISNFVME | | SNKHITKIAG | | LTGDNLCKEG | | DKSFIANDTG |
EEDLHETQVG | | SLNDAYLVPL | | HEHCTLSQSA | | INDHNTKSHI | | AAEKSGPEKK |
LVYQEINLAR | | KRQSVEAAIQ | | VDPIEEETPK | | DLLPVLMLHQ | | LQASVPGIHK |
TQNGVVQMPG | | SLAGVPFHSA | | ICNSSTNLLL | | AWLLVLNLKG | | SMNSFCQVDA |
HKATNKSSET | | LALLEILKHI | | AITEEADDLK | | AAVANLVEST | | TSHFGLSEKE |
QDMVPIDLSA | | NCSTVNIQSV | | PKCSENERTQ | | GISSLDGGCS | | ASEACAPEVC |
VLEVTCSPCE | | MCTVNKAYSP | | KETCNPSDTF | | FPSDGYGVDQ | | TSMNKACFLG |
EVCSLTDTVF | | SDKACAQKEN | | HTYEGACPID | | ETYVPVNVCN | | TIDFLNSKEN |
TYTDNLDSTE | | ELERGDDIQK | | DLNILTDPEY | | KNGFNTLVSH | | QNVSNLSSCG |
LCLSEKEAEL | | DKKHSSLDDF | | ENCSLRKFQD | | ENAYTSFDME | | EPRTSEEPGS |
ITNSMTSSER | | NISELESFEE | | LENHDTDIFN | | TVVNGGEQAT | | EELIQEEVEA |
SKTLELIDIS | | SKNIMEEKRM | | NGIIYEIISK | | RLATPPSLDF | | CYDSKQNSEK |
ETNEGETKMV | | KMMVKTMETG | | SYSESSPDLK | | KCIKSPVTSD | | WSDYRPDSDS |
EQPYKTSSDD | | PNDSGELTQE | | KEYNIGFVKR | | AIEKLYGKAD | | IIKPSFFPGS |
TRKSQVCPYN | | SVEFQCSRKA | | SLYDSEGQSF | | GSSEQVSSSS | | SMLQEFQEER |
QDKCDVSAVR | | DNYCRGDIVE | | PGTKQNDDSR | | ILTDIEEGVL | | IDKGKWLLKE |
NHLLRMSSEN | | PGMCGNADTT | | SVDTLLDNNS | | SEVPYSHFGN | | LAPGPTMDEL |
SSSELEELTQ | | PLELKCNYFN | | MPHGSDSEPF | | HEDLLDVRNE | | TCAKERIANH |
HTEEKGSHQS | | ERVCTSVTHS | | FISAGNKVYP | | VSDDAIKNQP | | LPGSNMIHGT |
LQEADSLDKL | | YALCGQHCPI | | LTVIIQPMNE | | EDRGFAYRKE | | SDIENFLGFY |
LWMKIHPYLL | | QTDKNVFREE | | NNKASMRQNL | | IDNAIGDIFD | | QFYFSNTFDL |
MGKRRKQKRI | | NFLGLEEEGN | | LKKFQPDLKE | | RFCMNFLHTS | | LLVVGNVDSN |
TQDLSGQTNE | | IFKAVDENNN | | LLNNRFQGSR | | TNLNQVVREN | | INCHYFFEML |
GQACLLDICQ | | VETSLNISNR | | NILELCMFEG | | ENLFIWEEED | | ILNLTDLESS |
REQEDL |
Задіяний у такому біологічному процесі, як біогенез та деградація війок. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.
Література
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10263 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P56715 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |