RPA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1EWI, 1FGU, 1JMC, 1L1O, 2B29, 2B3G, 4IJH, 4IJL, 4IPC, 4IPD, 4IPG, 4IPH, 4LUO, 4LUV, 4LUZ, 4LW1, 4LWC, 4NB3, 4O0A, 4R4C, 4R4I, 4R4O, 4R4Q, 4R4T, 5E7N, 5EAY

Ідентифікатори

Символи

RPA1, HSSB, MST075, REPA1, RF-A, RP-A, RPA70, Replication protein A1, PFBMFT6

Зовнішні ІД

OMIM: 179835 MGI: 1915525 HomoloGene: 2208 GeneCards: RPA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • single-stranded DNA binding • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • G-rich strand telomeric DNA binding • single-stranded telomeric DNA binding • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• PML body • нуклеоплазма • DNA replication factor A complex • клітинне ядро • site of DNA damage
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA recombination • interstrand cross-link repair • error-free translesion synthesis • G1 phase • error-prone translesion synthesis • cellular response to DNA damage stimulus • реплікація ДНК • regulation of cellular response to heat • DNA mismatch repair • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair • regulation of signal transduction by p53 class mediator • double-strand break repair via homologous recombination • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • protein localization to chromosome • telomere maintenance • telomere maintenance via semi-conservative replication • G1/S transition of mitotic cell cycle • DNA unwinding involved in DNA replication • telomere maintenance via telomerase • GO:0007126 мейоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6117


68275

Ensembl


ENSG00000132383


ENSMUSG00000000751

UniProt


P27694


Q8VEE4

RefSeq (мРНК)


NM_002945 NM_001355120 NM_001355121


NM_001164223 NM_026653

RefSeq (білок)


NP_002936 NP_001342049 NP_001342050


NP_001157695 NP_080929

Локус (UCSC)

Хр. 17: 1.83 – 1.9 Mb

Хр. 11: 75.19 – 75.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RPA1 (англ. Replication protein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 68 138^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVGQLSEGAI	AAIMQKGDTN	IKPILQVINI	RPITTGNSPP	RYRLLMSDGL
NTLSSFMLAT	QLNPLVEEEQ	LSSNCVCQIH	RFIVNTLKDG	RRVVILMELE
VLKSAEAVGV	KIGNPVPYNE	GLGQPQVAPP	APAASPAASS	RPQPQNGSSG
MGSTVSKAYG	ASKTFGKAAG	PSLSHTSGGT	QSKVVPIASL	TPYQSKWTIC
ARVTNKSQIR	TWSNSRGEGK	LFSLELVDES	GEIRATAFNE	QVDKFFPLIE
VNKVYYFSKG	TLKIANKQFT	AVKNDYEMTF	NNETSVMPCE	DDHHLPTVQF
DFTGIDDLEN	KSKDSLVDII	GICKSYEDAT	KITVRSNNRE	VAKRNIYLMD
TSGKVVTATL	WGEDADKFDG	SRQPVLAIKG	ARVSDFGGRS	LSVLSSSTII
ANPDIPEAYK	LRGWFDAEGQ	ALDGVSISDL	KSGGVGGSNT	NWKTLYEVKS
ENLGQGDKPD	YFSSVATVVY	LRKENCMYQA	CPTQDCNKKV	IDQQNGLYRC
EKCDTEFPNF	KYRMILSVNI	ADFQENQWVT	CFQESAEAIL	GQNAAYLGEL
KDKNEQAFEE	VFQNANFRSF	IFRVRVKVET	YNDESRIKAT	VMDVKPVDYR
EYGRRLVMSI	RRSALM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
He Z., Henricksen L.A., Wold M.S., Ingles C.J. (1995). RPA involvement in the damage-recognition and incision steps of nucleotide excision repair. Nature. 374: 566—569. PMID 7700386 DOI:10.1038/374566a0
Keshav K.F., Chen C., Dutta A. (1995). Rpa4, a homolog of the 34-kilodalton subunit of the replication protein A complex. Mol. Cell. Biol. 15: 3119—3128. PMID 7760808 DOI:10.1128/MCB.15.6.3119
Braun K.A., Lao Y., He Z., Ingles C.J., Wold M.S. (1997). Role of protein-protein interactions in the function of replication protein A (RPA): RPA modulates the activity of DNA polymerase alpha by multiple mechanisms. Biochemistry. 36: 8443—8454. PMID 9214288 DOI:10.1021/bi970473r
DeMott M.S., Zigman S., Bambara R.A. (1998). Replication protein A stimulates long patch DNA base excision repair. J. Biol. Chem. 273: 27492—27498. PMID 9765279 DOI:10.1074/jbc.273.42.27492
Zou L., Elledge S.J. (2003). Sensing DNA damage through ATRIP recognition of RPA-ssDNA complexes. Science. 300: 1542—1548. PMID 12791985 DOI:10.1126/science.1083430

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10289 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P27694 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.