RRAGA

Ідентифікатори

Символи

RRAGA, FIP-1, FIP1, RAGA, Ras related GTP binding A

Зовнішні ІД

OMIM: 612194 MGI: 1915691 HomoloGene: 68522 GeneCards: RRAGA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein homodimerization activity • GTP binding • phosphoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • ubiquitin protein ligase binding • protein heterodimerization activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • GATOR1 complex • lysosomal membrane • лізосома • клітинне ядро • Gtr1-Gtr2 GTPase complex
Біологічний процес	• cellular response to amino acid starvation • смерть клітини • positive regulation of cytolysis • positive regulation of TORC1 signaling • modulation by virus of host process • cellular response to amino acid stimulus • GO:0022415 viral process • negative regulation of autophagy • positive regulation of TOR signaling • GO:0097285 апоптоз • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of macroautophagy • cellular response to starvation • regulation of autophagy
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10670


68441

Ensembl


ENSG00000155876


ENSMUSG00000070934

UniProt


Q7L523


Q80X95

RefSeq (мРНК)


NM_006570


NM_178376

RefSeq (білок)


NP_006561


NP_848463

Локус (UCSC)

Хр. 9: 19.05 – 19.05 Mb

Хр. 4: 86.49 – 86.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RRAGA (англ. Ras related GTP binding A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 36 566^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPNTAMKKKV	LLMGKSGSGK	TSMRSIIFAN	YIARDTRRLG	ATIDVEHSHV
RFLGNLVLNL	WDCGGQDTFM	ENYFTSQRDN	IFRNVEVLIY	VFDVESRELE
KDMHYYQSCL	EAILQNSPDA	KIFCLVHKMD	LVQEDQRDLI	FKEREEDLRR
LSRPLECACF	RTSIWDETLY	KAWSSIVYQL	IPNVQQLEMN	LRNFAQIIEA
DEVLLFERAT	FLVISHYQCK	EQRDVHRFEK	ISNIIKQFKL	SCSKLAASFQ
SMEVRNSNFA	AFIDIFTSNT	YVMVVMSDPS	IPSAATLINI	RNARKHFEKL
ERVDGPKHSL	LMR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, лізосомі.

Література

Schuermann A., Brauers A., Massmann S., Becker W., Joost H.-G. (1995). Cloning of a novel family of mammalian GTP-binding proteins (RagA, RagBs, RagBl) with remote similarity to the Ras-related GTPases. J. Biol. Chem. 270: 28982—28988. PMID 7499430 DOI:10.1074/jbc.270.48.28982
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sekiguchi T., Hirose E., Nakashima N., Ii M., Nishimoto T. (2001). Novel G proteins, Rag C and Rag D, interact with GTP-binding proteins, Rag A and Rag B. J. Biol. Chem. 276: 7246—7257. PMID 11073942 DOI:10.1074/jbc.M004389200
Peng M., Yin N., Li M.O. (2014). Sestrins function as guanine nucleotide dissociation inhibitors for Rag GTPases to control mTORC1 signaling. Cell. 159: 122—133. PMID 25259925 DOI:10.1016/j.cell.2014.08.038
Li Y., Kang J., Horwitz M.S. (1997). Interaction of an adenovirus 14.7-kilodalton protein inhibitor of tumor necrosis factor alpha cytolysis with a new member of the GTPase superfamily of signal transducers. J. Virol. 71: 1576—1582. PMID 8995684
Hirose E., Nakashima N., Sekiguchi T., Nishimoto T. (1998). RagA is a functional homologue of S. cerevisiae Gtr1p involved in the Ran/Gsp1-GTPase pathway. J. Cell Sci. 111: 11—21. PMID 9394008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16963 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7L523 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.