RRP9

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4J0W, 4JXM

Ідентифікатори

Символи

RRP9, RNU3IP2, U3-55K, ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein

Зовнішні ІД

MGI: 2384313 HomoloGene: 3452 GeneCards: RRP9

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• U3 snoRNA binding • RNA binding • snoRNA binding
Клітинна компонента	• small-subunit processome • ядерце • box C/D RNP complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• rRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9136


27966

Ensembl


ENSG00000114767


ENSMUSG00000041506

UniProt


O43818


Q91WM3

RefSeq (мРНК)


NM_004704


NM_145620

RefSeq (білок)


NP_004695


NP_663595

Локус (UCSC)

Хр. 3: 51.93 – 51.94 Mb

Хр. 9: 106.35 – 106.36 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RRP9 (англ. Ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 51 841^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSATAAARKR	GKPASGAGAG	AGAGKRRRKA	DSAGDRGKSK	GGGKMNEEIS
SDSESESLAP	RKPEEEEEEE	LEETAQEKKL	RLAKLYLEQL	RQQEEEKAEA
RAFEEDQVAG	RLKEDVLEQR	GRLQKLVAKE	IQAPASADIR	VLRGHQLSIT
CLVVTPDDSA	IFSAAKDCSI	IKWSVESGRK	LHVIPRAKKG	AEGKPPGHSS
HVLCMAISSD	GKYLASGDRS	KLILIWEAQS	CQHLYTFTGH	RDAVSGLAFR
RGTHQLYSTS	HDRSVKVWNV	AENSYVETLF	GHQDAVAALD	ALSRECCVTA
GGRDGTVRVW	KIPEESQLVF	YGHQGSIDCI	HLINEEHMVS	GADDGSVALW
GLSKKRPLAL	QREAHGLRGE	PGLEQPFWIS	SVAALLNTDL	VATGSHSSCV
RLWQCGEGFR	QLDLLCDIPL	VGFINSLKFS	SSGDFLVAGV	GQEHRLGRWW
RIKEARNSVC	IIPLRRVPVP	PAAGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг рРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Pluk H., Soffner J., Luehrmann R., van Venrooij W.J. (1998). cDNA cloning and characterization of the human U3 small nucleolar ribonucleoprotein complex-associated 55-kilodalton protein. Mol. Cell. Biol. 18: 488—498. PMID 9418896 DOI:10.1128/MCB.18.1.488
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16829 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O43818 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.