RSAD2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9e/Viperin-CTP-SAH.png/250px-Viperin-CTP-SAH.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RSAD2, 2510004L01Rik, cig33, cig5, vig1, radical S-adenosyl methionine domain containing 2, Viperin Protein, Viperin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607810 MGI: 1929628 HomoloGene: 10969 GeneCards: RSAD2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • protein self-association • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • lipid droplet • мітохондріальна зовнішня мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • fibrillar center |
---|
Біологічний процес | • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • CD4-positive, alpha-beta T cell activation • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of toll-like receptor 7 signaling pathway • negative regulation of viral genome replication • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production • negative regulation of protein secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 6.87 – 6.9 Mb | Хр. 12: 26.49 – 26.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RSAD2 (англ. Radical S-adenosyl methionine domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 42 170[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MWVLTPAAFA | | GKLLSVFRQP | | LSSLWRSLVP | | LFCWLRATFW | | LLATKRRKQQ |
LVLRGPDETK | | EEEEDPPLPT | | TPTSVNYHFT | | RQCNYKCGFC | | FHTAKTSFVL |
PLEEAKRGLL | | LLKEAGMEKI | | NFSGGEPFLQ | | DRGEYLGKLV | | RFCKVELRLP |
SVSIVSNGSL | | IRERWFQNYG | | EYLDILAISC | | DSFDEEVNVL | | IGRGQGKKNH |
VENLQKLRRW | | CRDYRVAFKI | | NSVINRFNVE | | EDMTEQIKAL | | NPVRWKVFQC |
LLIEGENCGE | | DALREAERFV | | IGDEEFERFL | | ERHKEVSCLV | | PESNQKMKDS |
YLILDEYMRF | | LNCRKGRKDP | | SKSILDVGVE | | EAIKFSGFDE | | KMFLKRGGKY |
IWSKADLKLD | | W |
Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, групою 4fe-4s, залізо-сірчаною групою, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, ліпідних краплях, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.
Література
- Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
- Chin K.-C., Cresswell P. (2001). Viperin (cig5), an IFN-inducible antiviral protein directly induced by human cytomegalovirus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 15125—15130. PMID 11752458 DOI:10.1073/pnas.011593298
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Helbig K.J., Lau D.T.-Y., Semendric L., Harley H.A.J., Beard M.R. (2005). Analysis of ISG expression in chronic hepatitis C identifies viperin as a potential antiviral effector. Hepatology. 42: 702—710. PMID 16108059 DOI:10.1002/hep.20844
- Khaiboullina S.F., Rizvanov A.A., Holbrook M.R., St Jeor S. (2005). Yellow fever virus strains Asibi and 17D-204 infect human umbilical cord endothelial cells and induce novel changes in gene expression. Virology. 342: 167—176. PMID 16150475 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.035
- Severa M., Coccia E.M., Fitzgerald K.A. (2006). Toll-like receptor-dependent and -independent viperin gene expression and counter-regulation by PRDI-binding factor-1/BLIMP1. J. Biol. Chem. 281: 26188—26195. PMID 16849320 DOI:10.1074/jbc.M604516200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30908 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WXG1 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |