RSAD2

Ідентифікатори

Символи

RSAD2, 2510004L01Rik, cig33, cig5, vig1, radical S-adenosyl methionine domain containing 2, Viperin Protein, Viperin

Зовнішні ІД

OMIM: 607810 MGI: 1929628 HomoloGene: 10969 GeneCards: RSAD2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 4 iron, 4 sulfur cluster binding • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • protein self-association • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • lipid droplet • мітохондріальна зовнішня мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • fibrillar center
Біологічний процес	• CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • CD4-positive, alpha-beta T cell activation • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of toll-like receptor 7 signaling pathway • negative regulation of viral genome replication • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production • negative regulation of protein secretion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


91543


58185

Ensembl


ENSG00000134321


ENSMUSG00000020641

UniProt


Q8WXG1


Q8CBB9

RefSeq (мРНК)


NM_080657


NM_021384

RefSeq (білок)


NP_542388


NP_067359

Локус (UCSC)

Хр. 2: 6.87 – 6.9 Mb

Хр. 12: 26.49 – 26.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RSAD2 (англ. Radical S-adenosyl methionine domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 42 170^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWVLTPAAFA	GKLLSVFRQP	LSSLWRSLVP	LFCWLRATFW	LLATKRRKQQ
LVLRGPDETK	EEEEDPPLPT	TPTSVNYHFT	RQCNYKCGFC	FHTAKTSFVL
PLEEAKRGLL	LLKEAGMEKI	NFSGGEPFLQ	DRGEYLGKLV	RFCKVELRLP
SVSIVSNGSL	IRERWFQNYG	EYLDILAISC	DSFDEEVNVL	IGRGQGKKNH
VENLQKLRRW	CRDYRVAFKI	NSVINRFNVE	EDMTEQIKAL	NPVRWKVFQC
LLIEGENCGE	DALREAERFV	IGDEEFERFL	ERHKEVSCLV	PESNQKMKDS
YLILDEYMRF	LNCRKGRKDP	SKSILDVGVE	EAIKFSGFDE	KMFLKRGGKY
IWSKADLKLD	W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, групою 4fe-4s, залізо-сірчаною групою, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, ліпідних краплях, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.

Література

Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
Chin K.-C., Cresswell P. (2001). Viperin (cig5), an IFN-inducible antiviral protein directly induced by human cytomegalovirus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 15125—15130. PMID 11752458 DOI:10.1073/pnas.011593298
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Helbig K.J., Lau D.T.-Y., Semendric L., Harley H.A.J., Beard M.R. (2005). Analysis of ISG expression in chronic hepatitis C identifies viperin as a potential antiviral effector. Hepatology. 42: 702—710. PMID 16108059 DOI:10.1002/hep.20844
Khaiboullina S.F., Rizvanov A.A., Holbrook M.R., St Jeor S. (2005). Yellow fever virus strains Asibi and 17D-204 infect human umbilical cord endothelial cells and induce novel changes in gene expression. Virology. 342: 167—176. PMID 16150475 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.035
Severa M., Coccia E.M., Fitzgerald K.A. (2006). Toll-like receptor-dependent and -independent viperin gene expression and counter-regulation by PRDI-binding factor-1/BLIMP1. J. Biol. Chem. 281: 26188—26195. PMID 16849320 DOI:10.1074/jbc.M604516200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30908 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8WXG1 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.