RTN1

Ідентифікатори

Символи

RTN1, NSP, reticulon 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600865 MGI: 1933947 HomoloGene: 49654 GeneCards: RTN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • Golgi membrane • комплекс Ґольджі
Біологічний процес	• neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6252


104001

Ensembl


ENSG00000139970


ENSMUSG00000021087

UniProt


Q16799


Q8K0T0

RefSeq (мРНК)


NM_001243115 NM_021136 NM_206852 NM_206857 NM_001363702


NM_001007596 NM_001286448 NM_153457

RefSeq (білок)


NP_066959 NP_996734 NP_001350631


NP_001007597 NP_001273377 NP_703187

Локус (UCSC)

Хр. 14: 59.6 – 59.87 Mb

Хр. 12: 72.26 – 72.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RTN1 (англ. Reticulon 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 776 амінокислот, а молекулярна маса — 83 618^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPGDPQDE	LLPLAGPGSQ	WLRHRGEGEN	EAVTPKGATP	APQAGEPSPG
LGARAREAAS	REAGSGPARQ	SPVAMETAST	GVAGVSSAMD	HTFSTTSKDG
EGSCYTSLIS	DICYPPQEDS	TYFTGILQKE	NGHVTISESP	EELGTPGPSL
PDVPGIESRG	LFSSDSGIEM	TPAESTEVNK	ILADPLDQMK	AEAYKYIDIT
RPEEVKHQEQ	HHPELEDKDL	DFKNKDTDIS	IKPEGVREPD	KPAPVEGKII
KDHLLEESTF	APYIDDLSEE	QRRAPQITTP	VKITLTEIEP	SVETTTQEKT
PEKQDICLKP	SPDTVPTVTV	SEPEDDSPGS	ITPPSSGTEP	SAAESQGKGS
ISEDELITAI	KEAKGLSYET	AENPRPVGQL	ADRPEVKARS	GPPTIPSPLD
HEASSAESGD	SEIELVSEDP	MAAEDALPSG	YVSFGHVGGP	PPSPASPSIQ
YSILREEREA	ELDSELIIES	CDASSASEES	PKREQDSPPM	KPSALDAIRE
ETGVRAEERA	PSRRGLAEPG	SFLDYPSTEP	QPGPELPPGD	GALEPETPML
PRKPEEDSSS	NQSPAATKGP	GPLGPGAPPP	LLFLNKQKAI	DLLYWRDIKQ
TGIVFGSFLL	LLFSLTQFSV	VSVVAYLALA	ALSATISFRI	YKSVLQAVQK
TDEGHPFKAY	LELEITLSQE	QIQKYTDCLQ	FYVNSTLKEL	RRLFLVQDLV
DSLKFAVLMW	LLTYVGALFN	GLTLLLMAVV	SMFTLPVVYV	KHQAQIDQYL
GLVRTHINAV	VAKIQAKIPG	AKRHAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Urade T., Yamamoto Y., Zhang X., Ku Y., Sakisaka T. (2014). Identification and characterization of TMEM33 as a reticulon-binding protein. Kobe J. Med. Sci. 60: E57—E65. PMID 25612671

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10467 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16799 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.