RUFY1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2YQM, 2YW8

Ідентифікатори

Символи

RUFY1, RABIP4, ZFYVE12, RUN and FYVE domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610327 MGI: 2429762 HomoloGene: 23522 GeneCards: RUFY1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • lipid binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • early endosome membrane • ендосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• protein transport • ендоцитоз • phosphatidylinositol biosynthetic process • regulation of endocytosis • small GTPase mediated signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80230


216724

Ensembl


ENSG00000284260 ENSG00000176783


ENSMUSG00000020375

UniProt


Q96T51


Q8BIJ7

RefSeq (мРНК)


NM_001040451 NM_001040452 NM_025158


NM_172557

RefSeq (білок)


NP_001035541 NP_001035542 NP_079434


NP_766145

Локус (UCSC)

Хр. 5: 179.55 – 179.61 Mb

Хр. 11: 50.28 – 50.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RUFY1 (англ. RUN and FYVE domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 79 818^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADREGGCAA	GRGRELEPEL	EPGPGPGSAL	EPGEEFEIVD	RSQLPGPGDL
RSATRPRAAE	GWSAPILTLA	RRATGNLSAS	CGSALRAAAG	LGGGDSGDGT
ARAASKCQMM	EERANLMHMM	KLSIKVLLQS	ALSLGRSLDA	DHAPLQQFFV
VMEHCLKHGL	KVKKSFIGQN	KSFFGPLELV	EKLCPEASDI	ATSVRNLPEL
KTAVGRGRAW	LYLALMQKKL	ADYLKVLIDN	KHLLSEFYEP	EALMMEEEGM
VIVGLLVGLN	VLDANLCLKG	EDLDSQVGVI	DFSLYLKDVQ	DLDGGKEHER
ITDVLDQKNY	VEELNRHLSC	TVGDLQTKID	GLEKTNSKLQ	EELSAATDRI
CSLQEEQQQL	REQNELIRER	SEKSVEITKQ	DTKVELETYK	QTRQGLDEMY
SDVWKQLKEE	KKVRLELEKE	LELQIGMKTE	MEIAMKLLEK	DTHEKQDTLV
ALRQQLEEVK	AINLQMFHKA	QNAESSLQQK	NEAITSFEGK	TNQVMSSMKQ
MEERLQHSER	ARQGAEERSH	KLQQELGGRI	GALQLQLSQL	HEQCSSLEKE
LKSEKEQRQA	LQRELQHEKD	TSSLLRMELQ	QVEGLKKELR	ELQDEKAELQ
KICEEQEQAL	QEMGLHLSQS	KLKMEDIKEV	NQALKGHAWL	KDDEATHCRQ
CEKEFSISRR	KHHCRNCGHI	FCNTCSSNEL	ALPSYPKPVR	VCDSCHTLLL
QRCSSTAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yang J., Kim O., Wu J., Qiu Y. (2002). Interaction between tyrosine kinase Etk and a RUN-domain and FYVE-domain containing protein RUFY1. A possible role of Etk in regulation of vesicle trafficking. J. Biol. Chem. 277: 30219—30226. PMID 11877430 DOI:10.1074/jbc.M111933200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19760 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96T51 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.