RUFY1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/50/Protein_RUFY1_PDB_2YQM.png/250px-Protein_RUFY1_PDB_2YQM.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2YQM, 2YW8 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RUFY1, RABIP4, ZFYVE12, RUN and FYVE domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610327 MGI: 2429762 HomoloGene: 23522 GeneCards: RUFY1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • lipid binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • early endosome membrane • ендосома • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • protein transport • ендоцитоз • phosphatidylinositol biosynthetic process • regulation of endocytosis • small GTPase mediated signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/45/PBB_GE_RUFY1_218243_at_fs.png/250px-PBB_GE_RUFY1_218243_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000284260 ENSG00000176783 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001040451 NM_001040452 NM_025158 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001035541 NP_001035542 NP_079434 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 179.55 – 179.61 Mb | Хр. 11: 50.28 – 50.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RUFY1 (англ. RUN and FYVE domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 79 818[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADREGGCAA | | GRGRELEPEL | | EPGPGPGSAL | | EPGEEFEIVD | | RSQLPGPGDL |
RSATRPRAAE | | GWSAPILTLA | | RRATGNLSAS | | CGSALRAAAG | | LGGGDSGDGT |
ARAASKCQMM | | EERANLMHMM | | KLSIKVLLQS | | ALSLGRSLDA | | DHAPLQQFFV |
VMEHCLKHGL | | KVKKSFIGQN | | KSFFGPLELV | | EKLCPEASDI | | ATSVRNLPEL |
KTAVGRGRAW | | LYLALMQKKL | | ADYLKVLIDN | | KHLLSEFYEP | | EALMMEEEGM |
VIVGLLVGLN | | VLDANLCLKG | | EDLDSQVGVI | | DFSLYLKDVQ | | DLDGGKEHER |
ITDVLDQKNY | | VEELNRHLSC | | TVGDLQTKID | | GLEKTNSKLQ | | EELSAATDRI |
CSLQEEQQQL | | REQNELIRER | | SEKSVEITKQ | | DTKVELETYK | | QTRQGLDEMY |
SDVWKQLKEE | | KKVRLELEKE | | LELQIGMKTE | | MEIAMKLLEK | | DTHEKQDTLV |
ALRQQLEEVK | | AINLQMFHKA | | QNAESSLQQK | | NEAITSFEGK | | TNQVMSSMKQ |
MEERLQHSER | | ARQGAEERSH | | KLQQELGGRI | | GALQLQLSQL | | HEQCSSLEKE |
LKSEKEQRQA | | LQRELQHEKD | | TSSLLRMELQ | | QVEGLKKELR | | ELQDEKAELQ |
KICEEQEQAL | | QEMGLHLSQS | | KLKMEDIKEV | | NQALKGHAWL | | KDDEATHCRQ |
CEKEFSISRR | | KHHCRNCGHI | | FCNTCSSNEL | | ALPSYPKPVR | | VCDSCHTLLL |
QRCSSTAS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yang J., Kim O., Wu J., Qiu Y. (2002). Interaction between tyrosine kinase Etk and a RUN-domain and FYVE-domain containing protein RUFY1. A possible role of Etk in regulation of vesicle trafficking. J. Biol. Chem. 277: 30219—30226. PMID 11877430 DOI:10.1074/jbc.M111933200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19760 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96T51 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |