SAFB2
SAFB2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SAFB2, scaffold attachment factor B2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608066 MGI: 2146808 HomoloGene: 35210 GeneCards: SAFB2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 5.59 – 5.62 Mb | Хр. 17: 56.56 – 56.58 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
SAFB2 (англ. Scaffold attachment factor B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 953 амінокислот, а молекулярна маса — 107 473[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAETLPGSGD | SGPGTASLGP | GVAETGTRRL | SELRVIDLRA | ELKKRNLDTG | ||||
GNKSVLMERL | KKAVKEEGQD | PDEIGIELEA | TSKKSAKRCV | KGLKMEEEGT | ||||
EDNGLEDDSR | DGQEDMEASL | ENLQNMGMMD | MSVLDETEVA | NSSAPDFGED | ||||
GTDGLLDSFC | DSKEYVAAQL | RQLPAQPPEH | AVDGEGFKNT | LETSSLNFKV | ||||
TPDIEESLLE | PENEKILDIL | GETCKSEPVK | EESSELEQPF | AQDTSSVGPD | ||||
RKLAEEEDLF | DSAHPEEGDL | DLASESTAHA | QSSKADSLLA | VVKREPAEQP | ||||
GDGERTDCEP | VGLEPAVEQS | SAASELAEAS | SEELAEAPTE | APSPEARDSK | ||||
EDGRKFDFDA | CNEVPPAPKE | SSTSEGADQK | MSSFKEEKDI | KPIIKDEKGR | ||||
VGSGSGRNLW | VSGLSSTTRA | TDLKNLFSKY | GKVVGAKVVT | NARSPGARCY | ||||
GFVTMSTSDE | ATKCISHLHR | TELHGRMISV | EKAKNEPAGK | KLSDRKECEV | ||||
KKEKLSSVDR | HHSVEIKIEK | TVIKKEEKIE | KKEEKKPEDI | KKEEKDQDEL | ||||
KPGPTNRSRV | TKSGSRGMER | TVVMDKSKGE | PVISVKTTSR | SKERSSKSQD | ||||
RKSESKEKRD | ILSFDKIKEQ | RERERQRQRE | REIRETERRR | EREQREREQR | ||||
LEAFHERKEK | ARLQRERLQL | ECQRQRLERE | RMERERLERE | RMRVERERRK | ||||
EQERIHRERE | ELRRQQEQLR | YEQERRPGRR | PYDLDRRDDA | YWPEGKRVAM | ||||
EDRYRADFPR | PDHRFHDFDH | RDRGQYQDHA | IDRREGSRPM | MGDHRDGQHY | ||||
GDDRHGHGGP | PERHGRDSRD | GWGGYGSDKR | LSEGRGLPPP | PRGGRDWGEH | ||||
NQRLEEHQAR | AWQGAMDAGA | ASREHARWQG | GERGLSGPSG | PGHMASRGGV | ||||
AGRGGFAQGG | HSQGHVVPGG | GLEGGGVASQ | DRGSRVPHPH | PHPPPYPHFT | ||||
RRY |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Garee J.P., Meyer R., Oesterreich S. (2011). Co-repressor activity of scaffold attachment factor B1 requires sumoylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 408: 516—522. PMID 21527249 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.04.040
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21605 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 19
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |