SARAF : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SARAF

Ідентифікатори

Символи

SARAF, FOAP-7, TMEM66, XTP3, HSPC035, store-operated calcium entry associated regulatory factor

Зовнішні ІД

OMIM: 614768 MGI: 1915137 HomoloGene: 9398 GeneCards: SARAF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum-plasma membrane contact site
Біологічний процес	• ion transport • regulation of store-operated calcium entry • calcium ion transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51669


67887

Ensembl


ENSG00000133872


ENSMUSG00000031532

UniProt


Q96BY9


Q8R3Q0

RefSeq (мРНК)


NM_016127 NM_001284239


NM_026432

RefSeq (білок)


NP_001271168 NP_057211


NP_080708

Локус (UCSC)

Хр. 8: 30.06 – 30.08 Mb

Хр. 8: 34.62 – 34.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SARAF (англ. Store-operated calcium entry associated regulatory factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 36 975^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAACGPGAA	GYCLLLGLHL	FLLTAGPALG	WNDPDRMLLR	DVKALTLHYD
RYTTSRRLDP	IPQLKCVGGT	AGCDSYTPKV	IQCQNKGWDG	YDVQWECKTD
LDIAYKFGKT	VVSCEGYESS	EDQYVLRGSC	GLEYNLDYTE	LGLQKLKESG
KQHGFASFSD	YYYKWSSADS	CNMSGLITIV	VLLGIAFVVY	KLFLSDGQYS
PPPYSEYPPF	SHRYQRFTNS	AGPPPPGFKS	EFTGPQNTGH	GATSGFGSAF
TGQQGYENSG	PGFWTGLGTG	GILGYLFGSN	RAATPFSDSW	YYPSYPPSYP
GTWNRAYSPL	HGGSGSYSVC	SNSDTKTRTA	SGYGGTRRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Palty R., Raveh A., Kaminsky I., Meller R., Reuveny E. (2012). SARAF inactivates the store operated calcium entry machinery to prevent excess calcium refilling. Cell. 149: 425—438. PMID 22464749 DOI:10.1016/j.cell.2012.01.055
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28789 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96BY9 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.