SCFD1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f7/Protein_SCFD1_PDB_1y9j.png/250px-Protein_SCFD1_PDB_1y9j.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SCFD1, C14orf163, RA410, SLY1, SLY1P, STXBP1L2, sec1 family domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 618207 MGI: 1924233 HomoloGene: 5650 GeneCards: SCFD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • cis-Golgi network • клітинна мембрана • Golgi transport complex • Golgi-associated vesicle • Golgi cisterna membrane • ендоплазматичний ретикулум |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of autophagosome assembly • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • response to hypoxia • regulation of protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • toxin transport • post-Golgi vesicle-mediated transport • vesicle docking involved in exocytosis • COPII vesicle coating • GO:0000767 cell morphogenesis • protein transport • response to toxic substance • vesicle-mediated transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/07/PBB_GE_SCFD1_215548_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SCFD1_215548_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001257376 NM_001283031 NM_001283032 NM_001283033 NM_016106
| NM_182835 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001244305 NP_001269960 NP_001269961 NP_001269962 NP_057190
| NP_878255 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 30.62 – 30.74 Mb | Хр. 12: 51.42 – 51.5 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SCFD1 (англ. Sec1 family domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 642 амінокислот, а молекулярна маса — 72 380[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAAAATAA | | AAASIRERQT | | VALKRMLNFN | | VPHIKNSTGE | | PVWKVLIYDR |
FGQDIISPLL | | SVKELRDMGI | | TLHLLLHSDR | | DPIPDVPAVY | | FVMPTEENID |
RMCQDLRNQL | | YESYYLNFIS | | AISRSKLEDI | | ANAALAASAV | | TQVAKVFDQY |
LNFITLEDDM | | FVLCNQNKEL | | VSYRAINRPD | | ITDTEMETVM | | DTIVDSLFCF |
FVTLGAVPII | | RCSRGTAAEM | | VAVKLDKKLR | | ENLRDARNSL | | FTGDTLGAGQ |
FSFQRPLLVL | | VDRNIDLATP | | LHHTWTYQAL | | VHDVLDFHLN | | RVNLEESSGV |
ENSPAGARPK | | RKNKKSYDLT | | PVDKFWQKHK | | GSPFPEVAES | | VQQELESYRA |
QEDEVKRLKS | | IMGLEGEDEG | | AISMLSDNTA | | KLTSAVSSLP | | ELLEKKRLID |
LHTNVATAVL | | EHIKARKLDV | | YFEYEEKIMS | | KTTLDKSLLD | | IISDPDAGTP |
EDKMRLFLIY | | YISTQQAPSE | | ADLEQYKKAL | | TDAGCNLNPL | | QYIKQWKAFT |
KMASAPASYG | | STTTKPMGLL | | SRVMNTGSQF | | VMEGVKNLVL | | KQQNLPVTRI |
LDNLMEMKSN | | PETDDYRYFD | | PKMLRGNDSS | | VPRNKNPFQE | | AIVFVVGGGN |
YIEYQNLVDY | | IKGKQGKHIL | | YGCSELFNAT | | QFIKQLSQLG | | QK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20726 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WVM8 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |