SCFD1

Ідентифікатори

Символи

SCFD1, C14orf163, RA410, SLY1, SLY1P, STXBP1L2, sec1 family domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 618207 MGI: 1924233 HomoloGene: 5650 GeneCards: SCFD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • cis-Golgi network • клітинна мембрана • Golgi transport complex • Golgi-associated vesicle • Golgi cisterna membrane • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• negative regulation of autophagosome assembly • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • response to hypoxia • regulation of protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • toxin transport • post-Golgi vesicle-mediated transport • vesicle docking involved in exocytosis • COPII vesicle coating • GO:0000767 cell morphogenesis • protein transport • response to toxic substance • vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23256


76983

Ensembl


ENSG00000092108


ENSMUSG00000020952

UniProt


Q8WVM8


Q8BRF7

RefSeq (мРНК)

NM_001257376 NM_001283031 NM_001283032 NM_001283033 NM_016106
NM_182835


NM_029825 NM_001306178

RefSeq (білок)

NP_001244305 NP_001269960 NP_001269961 NP_001269962 NP_057190
NP_878255


NP_001293107 NP_084101

Локус (UCSC)

Хр. 14: 30.62 – 30.74 Mb

Хр. 12: 51.42 – 51.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCFD1 (англ. Sec1 family domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 642 амінокислот, а молекулярна маса — 72 380^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAAAATAA	AAASIRERQT	VALKRMLNFN	VPHIKNSTGE	PVWKVLIYDR
FGQDIISPLL	SVKELRDMGI	TLHLLLHSDR	DPIPDVPAVY	FVMPTEENID
RMCQDLRNQL	YESYYLNFIS	AISRSKLEDI	ANAALAASAV	TQVAKVFDQY
LNFITLEDDM	FVLCNQNKEL	VSYRAINRPD	ITDTEMETVM	DTIVDSLFCF
FVTLGAVPII	RCSRGTAAEM	VAVKLDKKLR	ENLRDARNSL	FTGDTLGAGQ
FSFQRPLLVL	VDRNIDLATP	LHHTWTYQAL	VHDVLDFHLN	RVNLEESSGV
ENSPAGARPK	RKNKKSYDLT	PVDKFWQKHK	GSPFPEVAES	VQQELESYRA
QEDEVKRLKS	IMGLEGEDEG	AISMLSDNTA	KLTSAVSSLP	ELLEKKRLID
LHTNVATAVL	EHIKARKLDV	YFEYEEKIMS	KTTLDKSLLD	IISDPDAGTP
EDKMRLFLIY	YISTQQAPSE	ADLEQYKKAL	TDAGCNLNPL	QYIKQWKAFT
KMASAPASYG	STTTKPMGLL	SRVMNTGSQF	VMEGVKNLVL	KQQNLPVTRI
LDNLMEMKSN	PETDDYRYFD	PKMLRGNDSS	VPRNKNPFQE	AIVFVVGGGN
YIEYQNLVDY	IKGKQGKHIL	YGCSELFNAT	QFIKQLSQLG	QK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20726 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WVM8 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.