SCMH1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2P0K

Ідентифікатори

Символи

SCMH1, Scml3, sex comb on midleg homolog 1 (Drosophila), Scm polycomb group protein homolog 1

Зовнішні ІД

OMIM: 616396 MGI: 1352762 HomoloGene: 32146 GeneCards: SCMH1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• chromocenter • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • anterior/posterior pattern specification • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22955


29871

Ensembl


ENSG00000010803


ENSMUSG00000000085

UniProt


Q96GD3


Q8K214

RefSeq (мРНК)

NM_001031694 NM_001172218 NM_001172219 NM_001172220 NM_001172221
NM_001172222 NM_012236 NM_001350667 NM_001350668 NM_001394299 NM_001394300 NM_001394301 NM_001394302 NM_001394303 NM_001394304 NM_001394305 NM_001394306 NM_001394307 NM_001394308 NM_001394309 NM_001394311

NM_001159630 NM_013883 NM_001355423 NM_001355424 NM_001379184
NM_001379185 NM_001379186

RefSeq (білок)

NP_001026864 NP_001165689 NP_001165690 NP_001165691 NP_001165692
NP_001165693 NP_036368 NP_001337596 NP_001337597

NP_001153102 NP_038911 NP_001342352 NP_001342353 NP_001366113
NP_001366114 NP_001366115 NP_001391019 NP_001391031 NP_001391032

Локус (UCSC)

Хр. 1: 41.03 – 41.24 Mb

Хр. 4: 120.26 – 120.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCMH1 (англ. Scm polycomb group protein homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 354^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVCYSVLAC	EILWDLPCSI	MGSPLGHFTW	DKYLKETCSV	PAPVHCFKQS
YTPPSNEFKI	SMKLEAQDPR	NTTSTCIATV	VGLTGARLRL	RLDGSDNKND
FWRLVDSAEI	QPIGNCEKNG	GMLQPPLGFR	LNASSWPMFL	LKTLNGAEMA
PIRIFHKEPP	SPSHNFFKMG	MKLEAVDRKN	PHFICPATIG	EVRGSEVLVT
FDGWRGAFDY	WCRFDSRDIF	PVGWCSLTGD	NLQPPGTKVV	IPKNPYPASD
VNTEKPSIHS	STKTVLEHQP	GQRGRKPGKK	RGRTPKTLIS	HPISAPSKTA
EPLKFPKKRG	PKPGSKRKPR	TLLNPPPASP	TTSTPEPDTS	TVPQDAATIP
SSAMQAPTVC	IYLNKNGSTG	PHLDKKKVQQ	LPDHFGPARA	SVVLQQAVQA
CIDCAYHQKT	VFSFLKQGHG	GEVISAVFDR	EQHTLNLPAV	NSITYVLRFL
EKLCHNLRSD	NLFGNQPFTQ	THLSLTAIEY	SHSHDRYLPG	ETFVLGNSLA
RSLEPHSDSM	DSASNPTNLV	STSQRHRPLL	SSCGLPPSTA	SAVRRLCSRG
VLKGSNERRD	MESFWKLNRS	PGSDRYLESR	DASRLSGRDP	SSWTVEDVMQ
FVREADPQLG	PHADLFRKHE	IDGKALLLLR	SDMMMKYMGL	KLGPALKLSY
HIDRLKQGKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19003 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96GD3 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.