SDC3

Ідентифікатори

Символи

SDC3, SDCN, SYND3, syndecan 3

Зовнішні ІД

OMIM: 186357 MGI: 1349163 HomoloGene: 7965 GeneCards: SDC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal lumen • Golgi lumen • cell surface • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • microspike
Біологічний процес	• glycosaminoglycan metabolic process • retinoid metabolic process • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • leukocyte migration • cell migration
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9672


20970

Ensembl


ENSG00000162512


ENSMUSG00000025743

UniProt


O75056


Q64519

RefSeq (мРНК)


NM_014654


NM_011520

RefSeq (білок)


NP_055469


NP_035650

Локус (UCSC)

Хр. 1: 30.87 – 30.91 Mb

Хр. 4: 130.52 – 130.55 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDC3 (англ. Syndecan 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот, а молекулярна маса — 45 497^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKPGPPHRAG	AAHGAGAGAG	AAAGPGARGL	LLPPLLLLLL	AGRAAGAQRW
RSENFERPVD	LEGSGDDDSF	PDDELDDLYS	GSGSGYFEQE	SGIETAMRFS
PDVALAVSTT	PAVLPTTNIQ	PVGTPFEELP	SERPTLEPAT	SPLVVTEVPE
EPSQRATTVS	TTMATTAATS	TGDPTVATVP	ATVATATPST	PAAPPFTATT
AVIRTTGVRR	LLPLPLTTVA	TARATTPEAP	SPPTTAAVLD	TEAPTPRLVS
TATSRPRALP	RPATTQEPDI	PERSTLPLGT	TAPGPTEVAQ	TPTPETFLTT
IRDEPEVPVS	GGPSGDFELP	EEETTQPDTA	NEVVAVGGAA	AKASSPPGTL
PKGARPGPGL	LDNAIDSGSS	AAQLPQKSIL	ERKEVLVAVI	VGGVVGALFA
AFLVTLLIYR	MKKKDEGSYT	LEEPKQASVT	YQKPDKQEEF	YA

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

Berndt C., Casaroli-Marano R.P., Vilaro S., Reina M. (2001). Cloning and characterization of human syndecan-3. J. Cell. Biochem. 82: 246—259. PMID 11527150 DOI:10.1002/jcb.1119
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Asundi V.K., Carey D.J. (1997). Phosphorylation of recombinant N-syndecan (syndecan 3) core protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 240: 502—506. PMID 9388509 DOI:10.1006/bbrc.1997.7684
Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10660 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75056 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.