SDK1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SDK1, sidekick cell adhesion molecule 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607216 MGI: 2444413 HomoloGene: 27395 GeneCards: SDK1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • міжклітинні контакти • синапс • мембрана • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • synapse assembly • адгезія клітин • retina layer formation • regulation of dendritic spine development • behavioral response to cocaine • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 3.3 – 4.27 Mb | Хр. 5: 141.23 – 142.2 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SDK1 (англ. Sidekick cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 213 амінокислот, а молекулярна маса — 242 112[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARGARPSAA | | GGGGGGAEPP | | ERAGPGRPRG | | SPPGRARPSL | | APRPGPEPSR |
PRAAPETSGG | | DTAGAGRCGG | | RRAAKLGPGR | | RGWWALLALQ | | LHLLRALAQD |
DVAPYFKTEP | | GLPQIHLEGN | | RLVLTCLAEG | | SWPLEFKWMR | | DDSELTTYSS |
EYKYIIPSLQ | | KLDAGFYRCV | | VRNRMGALLQ | | RKSEVQVAYM | | GSFMDTDQRK |
TVSQGRAAIL | | NLLPITSYPR | | PQVTWFREGH | | KIIPSNRIAI | | TLENQLVILA |
TTTSDAGAYY | | VQAVNEKNGE | | NKTSPFIHLS | | IARDVGTPET | | MAPTIVVPPG |
NRSVVAGSSE | | TTLECIASAR | | PVEDLSVTWK | | RNGVRITSGL | | HSFGRRLTIS |
NPTSADTGPY | | VCEAALPGSA | | FEPARATAFL | | FIIEPPYFTA | | EPESRISAEV |
EETVDIGCQA | | MGVPLPTLQW | | YKDAISISRL | | QNPRYKVLAS | | GGLRIQKLRP |
EDSGIFQCFA | | SNEGGEIQTH | | TYLDVTNIAP | | VFTQRPVDTT | | VTDGMTAILR |
CEVSGAPKPA | | ITWKRENHIL | | ASGSVRIPRF | | MLLESGGLQI | | APVFIQDAGN |
YTCYAANTEG | | SLNASATLTV | | WNRTSIVHPP | | EDHVVIKGTT | | ATLHCGATHD |
PRVSLRYVWK | | KDNVALTPSS | | TSRIVVEKDG | | SLLISQTWSG | | DIGDYSCEIV |
SEGGNDSRMA | | RLEVIELPHS | | PQNLLVSPNS | | SHSHAVVLSW | | VRPFDGNSPI |
LYYIVELSEN | | NSPWKVHLSN | | VGPEMTGVTV | | SGLTPARTYQ | | FRVCAVNEVG |
RGQYSAETSR | | LMLPEEPPSA | | PPKNIVASGR | | TNQSIMVQWQ | | PPPETEHNGV |
LRGYILRYRL | | AGLPGEYQQR | | NITSPEVNYC | | LVTDLIIWTQ | | YEIQVAAYNG |
AGLGVFSRAV | | TEYTLQGVPT | | APPQNVQTEA | | VNSTTIQFLW | | NPPPQQFING |
INQGYKLLAW | | PADAPEAVTV | | VTIAPDFHGV | | HHGHITNLKK | | FTAYFTSVLC |
FTTPGDGPPS | | TPQLVWTQED | | KPGAVGHLSF | | TEILDTSLKV | | SWQEPLEKNG |
IITGYQISWE | | VYGRNDSRLT | | HTLNSTTHEY | | KIQGLSSLTT | | YTIDVAAVTA |
VGTGLVTSST | | ISSGVPPDLP | | GAPSNLVISN | | ISPRSATLQF | | RPGYDGKTSI |
SRWIVEGQVG | | AIGDEEEWVT | | LYEEENEPDA | | QMLEIPNLTP | | YTHYRFRMKQ |
VNIVGPSPYS | | PSSRVIQTLQ | | APPDVAPTSV | | TVRTASETSL | | RLRWVPLPDS |
QYNGNPESVG | | YRIKYWRSDL | | QSSAVAQVVS | | DRLEREFTIE | | ELEEWMEYEL |
QMQAFNAVGA | | GPWSEVVRGR | | TRESVPSAAP | | ENVSAEAVSS | | TQILLTWTSV |
PEQDQNGLIL | | GYKILFRAKD | | LDPEPRSHIV | | RGNHTQSALL | | AGLRKFVLYE |
LQVLAFTRIG | | NGVPSTPLIL | | ERTKDDAPGP | | PVRLVFPEVR | | LTSVRIVWQP |
PEEPNGIILG | | YQIAYRLASS | | SPHTFTTVEV | | GATVRQFTAT | | DLAPESAYIF |
RLSAKTRQGW | | GEPLEATVIT | | TEKRERPAPP | | RELLVPQAEV | | TARSLRLQWV |
PGSDGASPIR | | YFTMQVRELP | | RGEWQTYSSS | | ISHEATACVV | | DRLRPFTSYK |
LRLKATNDIG | | DSDFSSETEA | | VTTLQDVPGE | | PPGSVSATPH | | TTSSVLIQWQ |
PPRDESLNGL | | LQGYRIYYRE | | LEYEAGSGTE | | AKTLKNPIAL | | HAELTAQSSF |
KTVNSSSTST | | MCELTHLKKY | | RRYEVIMTAY | | NIIGESPASA | | PVEVFVGEAA |
PAMAPQNVQV | | TPLTASQLEV | | TWDPPPPESQ | | NGNIQGYKIY | | YWEADSQNET |
EKMKVLFLPE | | PVVRLKNLTS | | HTKYLVSISA | | FNAAGDGPKS | | DPQQGRTHQA |
APGAPSFLAF | | SEITSTTLNV | | SWGEPAAANG | | ILQGYRVVYE | | PLAPVQGVSK |
VVTVEVRGNW | | QRWLKVRDLT | | KGVTYFFRVQ | | ARTITYGPEL | | QANITAGPAE |
GSPGSPRDVL | | VTKSASELTL | | QWTEGHSGDT | | PTTGYVIEAR | | PSDEGLWDMF |
VKDIPRSATS | | YTLSLDKLRQ | | GVTYEFRVVA | | VNEAGYGEPS | | NPSTAVSAQV |
EAPFYEEWWF | | LLVMALSSLI | | VILLVVFALV | | LHGQNKKYKN | | CSTGKGISTM |
EESVTLDNGG | | FAALELSSRH | | LNVKSTFSKK | | NGTRSPPRPS | | PGGLHYSDED |
ICNKYNGAVL | | TESVSLKEKS | | ADASESEATD | | SDYEDALPKH | | SFVNHYMSDP |
TYYNSWKRRA | | QGRAPAPHRY | | EAVAGSEAGA | | QLHPVITTQS | | AGGVYTPAGP |
GARTPLTGFS | | SFV |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Kaufman L., Hayashi K., Ross M.J., Ross M.D., Klotman P.E. (2004). Sidekick-1 is upregulated in glomeruli in HIV-associated nephropathy. J. Am. Soc. Nephrol. 15: 1721—1730. PMID 15213259 DOI:10.1097/01.ASN.0000128975.28958.C2
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19307 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z5N4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |