SDK1

Ідентифікатори

Символи

SDK1, sidekick cell adhesion molecule 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607216 MGI: 2444413 HomoloGene: 27395 GeneCards: SDK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • синапс • мембрана • клітинна мембрана
Біологічний процес	• synapse assembly • адгезія клітин • retina layer formation • regulation of dendritic spine development • behavioral response to cocaine • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


221935


330222

Ensembl


ENSG00000146555


ENSMUSG00000039683

UniProt


Q7Z5N4


Q3UH53

RefSeq (мРНК)


NM_001079653 NM_152744


NM_177879

RefSeq (білок)


NP_001073121 NP_689957


NP_808547

Локус (UCSC)

Хр. 7: 3.3 – 4.27 Mb

Хр. 5: 141.23 – 142.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDK1 (англ. Sidekick cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 213 амінокислот, а молекулярна маса — 242 112^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARGARPSAA	GGGGGGAEPP	ERAGPGRPRG	SPPGRARPSL	APRPGPEPSR
PRAAPETSGG	DTAGAGRCGG	RRAAKLGPGR	RGWWALLALQ	LHLLRALAQD
DVAPYFKTEP	GLPQIHLEGN	RLVLTCLAEG	SWPLEFKWMR	DDSELTTYSS
EYKYIIPSLQ	KLDAGFYRCV	VRNRMGALLQ	RKSEVQVAYM	GSFMDTDQRK
TVSQGRAAIL	NLLPITSYPR	PQVTWFREGH	KIIPSNRIAI	TLENQLVILA
TTTSDAGAYY	VQAVNEKNGE	NKTSPFIHLS	IARDVGTPET	MAPTIVVPPG
NRSVVAGSSE	TTLECIASAR	PVEDLSVTWK	RNGVRITSGL	HSFGRRLTIS
NPTSADTGPY	VCEAALPGSA	FEPARATAFL	FIIEPPYFTA	EPESRISAEV
EETVDIGCQA	MGVPLPTLQW	YKDAISISRL	QNPRYKVLAS	GGLRIQKLRP
EDSGIFQCFA	SNEGGEIQTH	TYLDVTNIAP	VFTQRPVDTT	VTDGMTAILR
CEVSGAPKPA	ITWKRENHIL	ASGSVRIPRF	MLLESGGLQI	APVFIQDAGN
YTCYAANTEG	SLNASATLTV	WNRTSIVHPP	EDHVVIKGTT	ATLHCGATHD
PRVSLRYVWK	KDNVALTPSS	TSRIVVEKDG	SLLISQTWSG	DIGDYSCEIV
SEGGNDSRMA	RLEVIELPHS	PQNLLVSPNS	SHSHAVVLSW	VRPFDGNSPI
LYYIVELSEN	NSPWKVHLSN	VGPEMTGVTV	SGLTPARTYQ	FRVCAVNEVG
RGQYSAETSR	LMLPEEPPSA	PPKNIVASGR	TNQSIMVQWQ	PPPETEHNGV
LRGYILRYRL	AGLPGEYQQR	NITSPEVNYC	LVTDLIIWTQ	YEIQVAAYNG
AGLGVFSRAV	TEYTLQGVPT	APPQNVQTEA	VNSTTIQFLW	NPPPQQFING
INQGYKLLAW	PADAPEAVTV	VTIAPDFHGV	HHGHITNLKK	FTAYFTSVLC
FTTPGDGPPS	TPQLVWTQED	KPGAVGHLSF	TEILDTSLKV	SWQEPLEKNG
IITGYQISWE	VYGRNDSRLT	HTLNSTTHEY	KIQGLSSLTT	YTIDVAAVTA
VGTGLVTSST	ISSGVPPDLP	GAPSNLVISN	ISPRSATLQF	RPGYDGKTSI
SRWIVEGQVG	AIGDEEEWVT	LYEEENEPDA	QMLEIPNLTP	YTHYRFRMKQ
VNIVGPSPYS	PSSRVIQTLQ	APPDVAPTSV	TVRTASETSL	RLRWVPLPDS
QYNGNPESVG	YRIKYWRSDL	QSSAVAQVVS	DRLEREFTIE	ELEEWMEYEL
QMQAFNAVGA	GPWSEVVRGR	TRESVPSAAP	ENVSAEAVSS	TQILLTWTSV
PEQDQNGLIL	GYKILFRAKD	LDPEPRSHIV	RGNHTQSALL	AGLRKFVLYE
LQVLAFTRIG	NGVPSTPLIL	ERTKDDAPGP	PVRLVFPEVR	LTSVRIVWQP
PEEPNGIILG	YQIAYRLASS	SPHTFTTVEV	GATVRQFTAT	DLAPESAYIF
RLSAKTRQGW	GEPLEATVIT	TEKRERPAPP	RELLVPQAEV	TARSLRLQWV
PGSDGASPIR	YFTMQVRELP	RGEWQTYSSS	ISHEATACVV	DRLRPFTSYK
LRLKATNDIG	DSDFSSETEA	VTTLQDVPGE	PPGSVSATPH	TTSSVLIQWQ
PPRDESLNGL	LQGYRIYYRE	LEYEAGSGTE	AKTLKNPIAL	HAELTAQSSF
KTVNSSSTST	MCELTHLKKY	RRYEVIMTAY	NIIGESPASA	PVEVFVGEAA
PAMAPQNVQV	TPLTASQLEV	TWDPPPPESQ	NGNIQGYKIY	YWEADSQNET
EKMKVLFLPE	PVVRLKNLTS	HTKYLVSISA	FNAAGDGPKS	DPQQGRTHQA
APGAPSFLAF	SEITSTTLNV	SWGEPAAANG	ILQGYRVVYE	PLAPVQGVSK
VVTVEVRGNW	QRWLKVRDLT	KGVTYFFRVQ	ARTITYGPEL	QANITAGPAE
GSPGSPRDVL	VTKSASELTL	QWTEGHSGDT	PTTGYVIEAR	PSDEGLWDMF
VKDIPRSATS	YTLSLDKLRQ	GVTYEFRVVA	VNEAGYGEPS	NPSTAVSAQV
EAPFYEEWWF	LLVMALSSLI	VILLVVFALV	LHGQNKKYKN	CSTGKGISTM
EESVTLDNGG	FAALELSSRH	LNVKSTFSKK	NGTRSPPRPS	PGGLHYSDED
ICNKYNGAVL	TESVSLKEKS	ADASESEATD	SDYEDALPKH	SFVNHYMSDP
TYYNSWKRRA	QGRAPAPHRY	EAVAGSEAGA	QLHPVITTQS	AGGVYTPAGP
GARTPLTGFS	SFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Kaufman L., Hayashi K., Ross M.J., Ross M.D., Klotman P.E. (2004). Sidekick-1 is upregulated in glomeruli in HIV-associated nephropathy. J. Am. Soc. Nephrol. 15: 1721—1730. PMID 15213259 DOI:10.1097/01.ASN.0000128975.28958.C2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19307 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z5N4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.