SEC13 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f0/Protein_SEC13_PDB_3BG0.png/250px-Protein_SEC13_PDB_3BG0.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3BG0, 3BG1, 5A9Q | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEC13, D3S1231E, SEC13L1, SEC13R, npp-20, SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600152 MGI: 99832 HomoloGene: 6479 GeneCards: SEC13 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • structural molecule activity |
---|
Клітинна компонента | • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • nuclear envelope • ядерна пора • нуклеоплазма • GATOR2 complex • nuclear pore outer ring • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • кінетохор • Golgi membrane • лізосома • lysosomal membrane • COPII vesicle coat • гіалоплазма • host cell |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • positive regulation of TOR signaling • sister chromatid cohesion • COPII-coated vesicle cargo loading • GO:0015915 транспорт • protein exit from endoplasmic reticulum • COPII-coated vesicle budding • positive regulation of TORC1 signaling • regulation of glycolytic process • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • GO:0022415 viral process • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/81/PBB_GE_SEC13_207707_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SEC13_207707_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001136026 NM_001136232 NM_001278946 NM_030673 NM_183352 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001129498 NP_001129704 NP_001265875 NP_109598 NP_899195 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 10.29 – 10.32 Mb | Хр. 6: 113.71 – 113.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEC13 (англ. SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 35 541[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVSVINTVDT | | SHEDMIHDAQ | | MDYYGTRLAT | | CSSDRSVKIF | | DVRNGGQILI |
ADLRGHEGPV | | WQVAWAHPMY | | GNILASCSYD | | RKVIIWREEN | | GTWEKSHEHA |
GHDSSVNSVC | | WAPHDYGLIL | | ACGSSDGAIS | | LLTYTGEGQW | | EVKKINNAHT |
IGCNAVSWAP | | AVVPGSLIDH | | PSGQKPNYIK | | RFASGGCDNL | | IKLWKEEEDG |
QWKEEQKLEA | | HSDWVRDVAW | | APSIGLPTST | | IASCSQDGRV | | FIWTCDDASS |
NTWSPKLLHK | | FNDVVWHVSW | | SITANILAVS | | GGDNKVTLWK | | ESVDGQWVCI |
SDVNKGQGSV | | SASVTEGQQN | | EQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, комплексі ядерної пори.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Enninga J., Levay A., Fontoura B.M. (2003). Sec13 shuttles between the nucleus and the cytoplasm and stably interacts with Nup96 at the nuclear pore complex. Mol. Cell. Biol. 23: 7271—7284. PMID 14517296 DOI:10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003
- Stankewich M.C., Stabach P.R., Morrow J.S. (2006). Human Sec31B: a family of new mammalian orthologues of yeast Sec31p that associate with the COPII coat. J. Cell Sci. 119: 958—969. PMID 16495487 DOI:10.1242/jcs.02751
- Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444
- Saxton R.A., Chantranupong L., Knockenhauer K.E., Schwartz T.U., Sabatini D.M. (2016). Mechanism of arginine sensing by CASTOR1 upstream of mTORC1. Nature. 536: 229—233. PMID 27487210 DOI:10.1038/nature19079
- Hsia K.C., Stavropoulos P., Blobel G., Hoelz A. (2007). Architecture of a coat for the nuclear pore membrane. Cell. 131: 1313—1326. PMID 18160040 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.038
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10697 (англ.) . Архів оригіналу за 25 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P55735 (англ.) . Архів оригіналу за 7 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |