SEC24C

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3EH2

Ідентифікатори

Символи

SEC24C, SEC24 homolog C, COPII coat complex component

Зовнішні ІД

OMIM: 607185 MGI: 1919746 HomoloGene: 3615 GeneCards: SEC24C

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • in utero embryonic development • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9632


218811

Ensembl


ENSG00000176986


ENSMUSG00000039367

UniProt


P53992


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_004922 NM_198597


NM_001168273 NM_172596

RefSeq (білок)


NP_004913 NP_940999


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 73.74 – 73.77 Mb

Хр. 14: 20.72 – 20.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEC24C (англ. SEC24 homolog C, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 094 амінокислот, а молекулярна маса — 118 325^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNVNQSVPPV	PPFGQPQPIY	PGYHQSSYGG	QSGSTAPAIP	YGAYNGPVPG
YQQTPPQGMS	RAPPSSGAPP	ASTAQAPCGQ	AAYGQFGQGD	VQNGPSSTVQ
MQRLPGSQPF	GSPLAPVGNQ	PPVLQPYGPP	PTSAQVATQL	SGMQISGAVA
PAPPSSGLGF	GPPTSLASAS	GSFPNSGLYG	SYPQGQAPPL	SQAQGHPGIQ
TPQRSAPSQA	SSFTPPASGG	PRLPSMTGPL	LPGQSFGGPS	VSQPNHVSSP
PQALPPGTQM	TGPLGPLPPM	HSPQQPGYQP	QQNGSFGPAR	GPQSNYGGPY
PAAPTFGSQP	GPPQPLPPKR	LDPDAIPSPI	QVIEDDRNNR	GTEPFVTGVR
GQVPPLVTTN	FLVKDQGNAS	PRYIRCTSYN	IPCTSDMAKQ	AQVPLAAVIK
PLARLPPEEA	SPYVVDHGES	GPLRCNRCKA	YMCPFMQFIE	GGRRFQCCFC
SCINDVPPQY	FQHLDHTGKR	VDAYDRPELS	LGSYEFLATV	DYCKNNKFPS
PPAFIFMIDV	SYNAIRTGLV	RLLCEELKSL	LDFLPREGGA	EESAIRVGFV
TYNKVLHFYN	VKSSLAQPQM	MVVSDVADMF	VPLLDGFLVN	VNESRAVITS
LLDQIPEMFA	DTRETETVFV	PVIQAGMEAL	KAAECAGKLF	LFHTSLPIAE
APGKLKNRDD	RKLINTDKEK	TLFQPQTGAY	QTLAKECVAQ	GCCVDLFLFP
NQYVDVATLS	VVPQLTGGSV	YKYASFQVEN	DQERFLSDLR	RDVQKVVGFD
AVMRVRTSTG	IRAVDFFGAF	YMSNTTDVEL	AGLDGDKTVT	VEFKHDDRLN
EESGALLQCA	LLYTSCAGQR	RLRIHNLALN	CCTQLADLYR	NCETDTLINY
MAKFAYRGVL	NSPVKAVRDT	LITQCAQILA	CYRKNCASPS	SAGQLILPEC
MKLLPVYLNC	VLKSDVLQPG	AEVTTDDRAY	VRQLVTSMDV	TETNVFFYPR
LLPLTKSPVE	STTEPPAVRA	SEERLSNGDI	YLLENGLNLF	LWVGASVQQG
VVQSLFSVSS	FSQITSGLSV	LPVLDNPLSK	KVRGLIDSLR	AQRSRYMKLT
VVKQEDKMEM	LFKHFLVEDK	SLSGGASYVD	FLCHMHKEIR	QLLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tani K., Oyama Y., Hatsuzawa K., Tagaya M. (1999). Hypothetical protein KIAA0079 is a mammalian homologue of yeast Sec24p. FEBS Lett. 447: 247—250. PMID 10214955 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00303-8
Tang B.L., Kausalya J., Low D.Y.H., Lock M.L., Hong W. (1999). A family of mammalian proteins homologous to yeast Sec24p. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 679—684. PMID 10329445 DOI:10.1006/bbrc.1999.0574
Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10705 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P53992 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.