SEC31A

SEC31A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3WXA

Ідентифікатори
Символи SEC31A, ABP125, ABP130, HSPC334, SEC31L1, HSPC275, SEC31 homolog A, COPII coat complex component, NEDSOSB, HPBKS
Зовнішні ІД OMIM: 610257 MGI: 1916412 HomoloGene: 42056 GeneCards: SEC31A
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
calcium-dependent protein binding
structural molecule activity

Клітинна компонента

COPII-coated ER to Golgi transport vesicle
GO:0016023 cytoplasmic vesicle
ER to Golgi transport vesicle membrane
внутрішньоклітинна мембранна органела
perinuclear region of cytoplasm
мембрана
ендоплазматичний ретикулум
цитоплазма
endoplasmic reticulum exit site
endoplasmic reticulum membrane
vesicle coat
Golgi membrane
гіалоплазма
COPII vesicle coat

Біологічний процес

IRE1-mediated unfolded protein response
response to calcium ion
COPII vesicle coating
vesicle-mediated transport
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
protein transport
antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
COPII-coated vesicle cargo loading
intracellular protein transport
COPII-coated vesicle budding
endoplasmic reticulum organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
22872
69162
Ensembl
ENSG00000138674
ENSMUSG00000035325
UniProt
O94979
Q3UPL0
RefSeq (мРНК)
NM_001077206
NM_001077207
NM_001077208
NM_001191049
NM_001300744
NM_001300745
NM_014933
NM_016211
NM_001318119
NM_001318120
NM_026969
NM_001359323
NM_001359332
NM_001359344
NM_001359348
NM_001359349
NM_001359350
NM_001400516
NM_001400517
RefSeq (білок)
NP_001070674
NP_001070675
NP_001070676
NP_001177978
NP_001287673
NP_001287674
NP_001305048
NP_001305049
NP_057295
NP_081245
NP_001346252
NP_001346261
NP_001346273
NP_001346277
NP_001346278
NP_001346279
NP_001387445
NP_001387446
Локус (UCSC) Хр. 4: 82.82 – 82.9 Mb Хр. 5: 100.51 – 100.56 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SEC31A (англ. SEC31 homolog A, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 220 амінокислот, а молекулярна маса — 133 015[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDL
SDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIIL
YDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIW
DLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRK
NEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFAS
SPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELP
TNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLS
SSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSF
GGKLVTFENVRMPSHQGAEQQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQ
SQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDL
GKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSDGEESPAAEEQLLGEHIKEEKEE
SEFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDNRMADAII
LAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWR
EALAAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEK
LVACWTKAQDGSHPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKM
SQYANLLAAQGSIAAALAFLPDNTNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESP
KIPYEKQQLPKGRPGPVAGHHQMPRVQTQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVN
PNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVA
PPTSNAYPNTPYISSASSYTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSG
ASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPASQRTGPQNGWNDPPA
LNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQS
SFPQPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQ
SLPTKKITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRL
EFLYDKLREQTLSPTITSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSE
TSAFMPVLKVVLTQANKLGV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444
  • Shibata H., Suzuki H., Yoshida H., Maki M. (2007). ALG-2 directly binds Sec31A and localizes at endoplasmic reticulum exit sites in a Ca2+-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 353: 756—763. PMID 17196169 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.101

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17052 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, O94979 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.