SEMA6C |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEMA6C, SEMAY, m-SemaY, m-SemaY2, semaphorin 6C, Sema-Y |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609294 MGI: 1338032 HomoloGene: 7931 GeneCards: SEMA6C |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity • neuropilin binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • цитоплазма • cell surface • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • axon guidance • negative regulation of axon extension • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/08/PBB_GE_SEMA6C_208100_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SEMA6C_208100_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001178061 NM_001178062 NM_030913 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001171532 NP_001171533 NP_112175 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 151.13 – 151.15 Mb | Хр. 3: 95.16 – 95.17 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA6C (англ. Semaphorin 6C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 99 686[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRAPHFMPL | | LLLLLLLSLP | | HTQAAFPQDP | | LPLLISDLQG | | TSPLSWFRGL |
EDDAVAAELG | | LDFQRFLTLN | | RTLLVAARDH | | VFSFDLQAEE | | EGEGLVPNKY |
LTWRSQDVEN | | CAVRGKLTDE | | CYNYIRVLVP | | WDSQTLLACG | | TNSFSPVCRS |
YGITSLQQEG | | EELSGQARCP | | FDATQSNVAI | | FAEGSLYSAT | | AADFQASDAV |
VYRSLGPQPP | | LRSAKYDSKW | | LREPHFVQAL | | EHGDHVYFFF | | REVSVEDARL |
GRVQFSRVAR | | VCKRDMGGSP | | RALDRHWTSF | | LKLRLNCSVP | | GDSTFYFDVL |
QALTGPVNLH | | GRSALFGVFT | | TQTNSIPGSA | | VCAFYLDEIE | | RGFEGKFKEQ |
RSLDGAWTPV | | SEDRVPSPRP | | GSCAGVGGAA | | LFSSSRDLPD | | DVLTFIKAHP |
LLDPAVPPVT | | HQPLLTLTSR | | ALLTQVAVDG | | MAGPHSNITV | | MFLGSNDGTV |
LKVLTPGGRS | | GGPEPILLEE | | IDAYSPARCS | | GKRTAQTARR | | IIGLELDTEG |
HRLFVAFSGC | | IVYLPLSRCA | | RHGACQRSCL | | ASQDPYCGWH | | SSRGCVDIRG |
SGGTDVDQAG | | NQESMEHGDC | | QDGATGSQSG | | PGDSAYGVRR | | DLPPASASRS |
VPIPLLLASV | | AAAFALGASV | | SGLLVSCACR | | RAHRRRGKDI | | ETPGLPRPLS |
LRSLARLHGG | | GPEPPPPSKD | | GDAVQTPQLY | | TTFLPPPEGV | | PPPELACLPT |
PESTPELPVK | | HLRAAGDPWE | | WNQNRNNAKE | | GPGRSRGGHA | | AGGPAPRVLV |
RPPPPGCPGQ | | AVEVTTLEEL | | LRYLHGPQPP | | RKGAEPPAPL | | TSRALPPEPA |
PALLGGPSPR | | PHECASPLRL | | DVPPEGRCAS | | APARPALSAP | | APRLGVGGGR |
RLPFSGHRAP | | PALLTRVPSG | | GPSRYSGGPG | | KHLLYLGRPE | | GYRGRALKRV |
DVEKPQLSLK | | PPLVGPSSRQ | | AVPNGGRFNF |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10740 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H3T2 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |