SEMA6C

Ідентифікатори

Символи

SEMA6C, SEMAY, m-SemaY, m-SemaY2, semaphorin 6C, Sema-Y

Зовнішні ІД

OMIM: 609294 MGI: 1338032 HomoloGene: 7931 GeneCards: SEMA6C

Онтологія гена
Молекулярна функція	• semaphorin receptor binding • chemorepellent activity • neuropilin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • цитоплазма • cell surface • міжклітинний простір
Біологічний процес	• multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • axon guidance • negative regulation of axon extension • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10500


20360

Ensembl


ENSG00000143434


ENSMUSG00000038777

UniProt


Q9H3T2


Q9WTM3

RefSeq (мРНК)


NM_001178061 NM_001178062 NM_030913


NM_001272024 NM_011351

RefSeq (білок)


NP_001171532 NP_001171533 NP_112175


NP_001258953 NP_035481

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.13 – 151.15 Mb

Хр. 3: 95.16 – 95.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA6C (англ. Semaphorin 6C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 99 686^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRAPHFMPL	LLLLLLLSLP	HTQAAFPQDP	LPLLISDLQG	TSPLSWFRGL
EDDAVAAELG	LDFQRFLTLN	RTLLVAARDH	VFSFDLQAEE	EGEGLVPNKY
LTWRSQDVEN	CAVRGKLTDE	CYNYIRVLVP	WDSQTLLACG	TNSFSPVCRS
YGITSLQQEG	EELSGQARCP	FDATQSNVAI	FAEGSLYSAT	AADFQASDAV
VYRSLGPQPP	LRSAKYDSKW	LREPHFVQAL	EHGDHVYFFF	REVSVEDARL
GRVQFSRVAR	VCKRDMGGSP	RALDRHWTSF	LKLRLNCSVP	GDSTFYFDVL
QALTGPVNLH	GRSALFGVFT	TQTNSIPGSA	VCAFYLDEIE	RGFEGKFKEQ
RSLDGAWTPV	SEDRVPSPRP	GSCAGVGGAA	LFSSSRDLPD	DVLTFIKAHP
LLDPAVPPVT	HQPLLTLTSR	ALLTQVAVDG	MAGPHSNITV	MFLGSNDGTV
LKVLTPGGRS	GGPEPILLEE	IDAYSPARCS	GKRTAQTARR	IIGLELDTEG
HRLFVAFSGC	IVYLPLSRCA	RHGACQRSCL	ASQDPYCGWH	SSRGCVDIRG
SGGTDVDQAG	NQESMEHGDC	QDGATGSQSG	PGDSAYGVRR	DLPPASASRS
VPIPLLLASV	AAAFALGASV	SGLLVSCACR	RAHRRRGKDI	ETPGLPRPLS
LRSLARLHGG	GPEPPPPSKD	GDAVQTPQLY	TTFLPPPEGV	PPPELACLPT
PESTPELPVK	HLRAAGDPWE	WNQNRNNAKE	GPGRSRGGHA	AGGPAPRVLV
RPPPPGCPGQ	AVEVTTLEEL	LRYLHGPQPP	RKGAEPPAPL	TSRALPPEPA
PALLGGPSPR	PHECASPLRL	DVPPEGRCAS	APARPALSAP	APRLGVGGGR
RLPFSGHRAP	PALLTRVPSG	GPSRYSGGPG	KHLLYLGRPE	GYRGRALKRV
DVEKPQLSLK	PPLVGPSSRQ	AVPNGGRFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10740 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H3T2 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.