SEMA7A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3NVQ

Ідентифікатори

Символи

SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11

Зовнішні ІД

OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • integrin binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity
Клітинна компонента	• мембрана • клітинна мембрана • anchored component of membrane • міжклітинний простір • external side of plasma membrane • integral component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• диференціація клітин • positive regulation of protein phosphorylation • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • osteoblast differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • axon extension • olfactory lobe development • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of axon extension • inflammatory response • neuron projection development • regulation of inflammatory response • negative chemotaxis • positive regulation of macrophage cytokine production • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8482


20361

Ensembl


ENSG00000138623 ENSG00000288455


ENSMUSG00000038264

UniProt


O75326


Q9QUR8

RefSeq (мРНК)


NM_003612 NM_001146029 NM_001146030


NM_011352

RefSeq (білок)


NP_001139501 NP_001139502 NP_003603


NP_035482

Локус (UCSC)

Хр. 15: 74.41 – 74.43 Mb

Хр. 9: 57.85 – 57.87 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA7A (англ. Semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 74 824^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPPPPGRAA	PSAPRARVPG	PPARLGLPLR	LRLLLLLWAA	AASAQGHLRS
GPRIFAVWKG	HVGQDRVDFG	QTEPHTVLFH	EPGSSSVWVG	GRGKVYLFDF
PEGKNASVRT	VNIGSTKGSC	LDKRDCENYI	TLLERRSEGL	LACGTNARHP
SCWNLVNGTV	VPLGEMRGYA	PFSPDENSLV	LFEGDEVYST	IRKQEYNGKI
PRFRRIRGES	ELYTSDTVMQ	NPQFIKATIV	HQDQAYDDKI	YYFFREDNPD
KNPEAPLNVS	RVAQLCRGDQ	GGESSLSVSK	WNTFLKAMLV	CSDAATNKNF
NRLQDVFLLP	DPSGQWRDTR	VYGVFSNPWN	YSAVCVYSLG	DIDKVFRTSS
LKGYHSSLPN	PRPGKCLPDQ	QPIPTETFQV	ADRHPEVAQR	VEPMGPLKTP
LFHSKYHYQK	VAVHRMQASH	GETFHVLYLT	TDRGTIHKVV	EPGEQEHSFA
FNIMEIQPFR	RAAAIQTMSL	DAERRKLYVS	SQWEVSQVPL	DLCEVYGGGC
HGCLMSRDPY	CGWDQGRCIS	IYSSERSVLQ	SINPAEPHKE	CPNPKPDKAP
LQKVSLAPNS	RYYLSCPMES	RHATYSWRHK	ENVEQSCEPG	HQSPNCILFI
ENLTAQQYGH	YFCEAQEGSY	FREAQHWQLL	PEDGIMAEHL	LGHACALAAS
LWLGVLPTLT	LGLLVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pasterkamp R.J., Peschon J.J., Spriggs M.K., Kolodkin A.L. (2003). Semaphorin 7A promotes axon outgrowth through integrins and MAPKs. Nature. 424: 398—405. PMID 12879062 DOI:10.1038/nature01790
Scott G.A., McClelland L.A., Fricke A.F. (2008). Semaphorin 7a promotes spreading and dendricity in human melanocytes through beta1-integrins. J. Invest. Dermatol. 128: 151—161. PMID 17671519 DOI:10.1038/sj.jid.5700974
Richard M., St-Laurent J., Perreault J., Long A., St-Louis M. (2011). A new SEMA7A variant found in Native Americans with alloantibody. Vox Sang. 100: 322—326. PMID 20854351 DOI:10.1111/j.1423-0410.2010.01413.x
Angelisova P., Drbal K., Cerny J., Hilgert I., Horejsi V. (1999). Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. Immunobiology. 200: 234—245. PMID 10416131

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10741 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O75326 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350