SH3GLB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X43

Ідентифікатори

Символи

SH3GLB1, Bif-1, PPP1R70, dJ612B15.2, CGI-61, SH3 domain containing GRB2 like endophilin B1, SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1

Зовнішні ІД

OMIM: 609287 MGI: 1859730 HomoloGene: 9337 GeneCards: SH3GLB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • lipid binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана • autophagosome membrane • midbody • мітохондрія • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма
Біологічний процес	• cellular response to glucose starvation • regulation of cytokinesis • regulation of protein stability • positive regulation of autophagosome assembly • positive regulation of autophagy • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cellular response to amino acid starvation • receptor catabolic process • автофагія • protein complex oligomerization • membrane fission • positive regulation of protein oligomerization • positive regulation of membrane tubulation • autophagic cell death • regulation of macroautophagy • protein localization to vacuolar membrane • GO:0097285 апоптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51100


54673

Ensembl


ENSG00000097033


ENSMUSG00000037062

UniProt


Q9Y371


Q9JK48

RefSeq (мРНК)


NM_001206651 NM_001206652 NM_001206653 NM_016009

NM_001282037 NM_001282042 NM_019464 NM_001379170 NM_001379171
NM_001379172 NM_001379173 NM_001379174

RefSeq (білок)


NP_001193580 NP_001193581 NP_001193582 NP_057093

NP_001268966 NP_001268971 NP_062337 NP_001366099 NP_001366100
NP_001366101 NP_001366102 NP_001366103

Локус (UCSC)

Хр. 1: 86.7 – 86.75 Mb

Хр. 3: 144.39 – 144.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SH3GLB1 (англ. SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 796^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNIMDFNVKK	LAADAGTFLS	RAVQFTEEKL	GQAEKTELDA	HLENLLSKAE
CTKIWTEKIM	KQTEVLLQPN	PNARIEEFVY	EKLDRKAPSR	INNPELLGQY
MIDAGTEFGP	GTAYGNALIK	CGETQKRIGT	ADRELIQTSA	LNFLTPLRNF
IEGDYKTIAK	ERKLLQNKRL	DLDAAKTRLK	KAKAAETRNS	SEQELRITQS
EFDRQAEITR	LLLEGISSTH	AHHLRCLNDF	VEAQMTYYAQ	CYQYMLDLQK
QLGSFPSNYL	SNNNQTSVTP	VPSVLPNAIG	SSAMASTSGL	VITSPSNLSD
LKECSGSRKA	RVLYDYDAAN	STELSLLADE	VITVFSVVGM	DSDWLMGERG
NQKGKVPITY	LELLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, автофагія, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.

Література

Modregger J., Schmidt A.A., Ritter B., Huttner W.B., Plomann M. (2003). Characterization of endophilin B1b, a brain-specific membrane-associated lysophosphatidic acid acyl transferase with properties distinct from endophilin A1. J. Biol. Chem. 278: 4160—4167. PMID 12456676 DOI:10.1074/jbc.M208568200
Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Karbowski M., Jeong S.-Y., Youle R.J. (2004). Endophilin B1 is required for the maintenance of mitochondrial morphology. J. Cell Biol. 166: 1027—1039. PMID 15452144 DOI:10.1083/jcb.200407046
Thoresen S.B., Pedersen N.M., Liestol K., Stenmark H. (2010). A phosphatidylinositol 3-kinase class III sub-complex containing VPS15, VPS34, Beclin 1, UVRAG and BIF-1 regulates cytokinesis and degradative endocytic traffic. Exp. Cell Res. 316: 3368—3378. PMID 20643123 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.07.008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10833 (англ.) . Архів оригіналу за 24 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y371 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.