SH3GLB1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/07/Protein_SH3GLB1_PDB_1x43.png/250px-Protein_SH3GLB1_PDB_1x43.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SH3GLB1, Bif-1, PPP1R70, dJ612B15.2, CGI-61, SH3 domain containing GRB2 like endophilin B1, SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609287 MGI: 1859730 HomoloGene: 9337 GeneCards: SH3GLB1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • lipid binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана • autophagosome membrane • midbody • мітохондрія • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • cellular response to glucose starvation • regulation of cytokinesis • regulation of protein stability • positive regulation of autophagosome assembly • positive regulation of autophagy • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cellular response to amino acid starvation • receptor catabolic process • автофагія • protein complex oligomerization • membrane fission • positive regulation of protein oligomerization • positive regulation of membrane tubulation • autophagic cell death • regulation of macroautophagy • protein localization to vacuolar membrane • GO:0097285 апоптоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/PBB_GE_SH3GLB1_209090_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SH3GLB1_209090_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fb/PBB_GE_SH3GLB1_209091_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SH3GLB1_209091_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/63/PBB_GE_SH3GLB1_210101_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SH3GLB1_210101_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001206651 NM_001206652 NM_001206653 NM_016009 |
| NM_001282037 NM_001282042 NM_019464 NM_001379170 NM_001379171
| NM_001379172 NM_001379173 NM_001379174 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001193580 NP_001193581 NP_001193582 NP_057093 |
| NP_001268966 NP_001268971 NP_062337 NP_001366099 NP_001366100
| NP_001366101 NP_001366102 NP_001366103 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 86.7 – 86.75 Mb | Хр. 3: 144.39 – 144.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SH3GLB1 (англ. SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 796[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNIMDFNVKK | | LAADAGTFLS | | RAVQFTEEKL | | GQAEKTELDA | | HLENLLSKAE |
CTKIWTEKIM | | KQTEVLLQPN | | PNARIEEFVY | | EKLDRKAPSR | | INNPELLGQY |
MIDAGTEFGP | | GTAYGNALIK | | CGETQKRIGT | | ADRELIQTSA | | LNFLTPLRNF |
IEGDYKTIAK | | ERKLLQNKRL | | DLDAAKTRLK | | KAKAAETRNS | | SEQELRITQS |
EFDRQAEITR | | LLLEGISSTH | | AHHLRCLNDF | | VEAQMTYYAQ | | CYQYMLDLQK |
QLGSFPSNYL | | SNNNQTSVTP | | VPSVLPNAIG | | SSAMASTSGL | | VITSPSNLSD |
LKECSGSRKA | | RVLYDYDAAN | | STELSLLADE | | VITVFSVVGM | | DSDWLMGERG |
NQKGKVPITY | | LELLN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, автофагія, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.
Література
- Modregger J., Schmidt A.A., Ritter B., Huttner W.B., Plomann M. (2003). Characterization of endophilin B1b, a brain-specific membrane-associated lysophosphatidic acid acyl transferase with properties distinct from endophilin A1. J. Biol. Chem. 278: 4160—4167. PMID 12456676 DOI:10.1074/jbc.M208568200
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Karbowski M., Jeong S.-Y., Youle R.J. (2004). Endophilin B1 is required for the maintenance of mitochondrial morphology. J. Cell Biol. 166: 1027—1039. PMID 15452144 DOI:10.1083/jcb.200407046
- Thoresen S.B., Pedersen N.M., Liestol K., Stenmark H. (2010). A phosphatidylinositol 3-kinase class III sub-complex containing VPS15, VPS34, Beclin 1, UVRAG and BIF-1 regulates cytokinesis and degradative endocytic traffic. Exp. Cell Res. 316: 3368—3378. PMID 20643123 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.07.008
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10833 (англ.) . Архів оригіналу за 24 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y371 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |