SHOC2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SHOC2, SIAA0862, SOC2, SUR8, SHOC2 leucine-rich repeat scaffold protein, leucine rich repeat scaffold protein, SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein, NSLH1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602775 MGI: 1927197 HomoloGene: 7219 GeneCards: SHOC2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein phosphatase 1 binding • protein phosphatase regulator activity • protein phosphatase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein serine/threonine phosphatase activity |
---|
Клітинна компонента | • protein phosphatase type 1 complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • photoreceptor inner segment • photoreceptor outer segment membrane |
---|
Біологічний процес | • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of Ras protein signal transduction • Ras protein signal transduction • regulation of phosphoprotein phosphatase activity • GO:0016576 protein dephosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/17/PBB_GE_SHOC2_202777_at_fs.png/250px-PBB_GE_SHOC2_202777_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001269039 NM_007373 NM_001324336 NM_001324337 |
| | NM_001168505 NM_019658 NM_001355242 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001255968 NP_001311265 NP_001311266 NP_031399 |
| | NP_001161977 NP_062632 NP_001342171 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 110.92 – 111.02 Mb | Хр. 19: 53.93 – 54.02 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SHOC2 (англ. SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 64 888[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSSLGKEKD | | SKEKDPKVPS | | AKEREKEAKA | | SGGFGKESKE | | KEPKTKGKDA |
KDGKKDSSAA | | QPGVAFSVDN | | TIKRPNPAPG | | TRKKSSNAEV | | IKELNKCREE |
NSMRLDLSKR | | SIHILPSSIK | | ELTQLTELYL | | YSNKLQSLPA | | EVGCLVNLMT |
LALSENSLTS | | LPDSLDNLKK | | LRMLDLRHNK | | LREIPSVVYR | | LDSLTTLYLR |
FNRITTVEKD | | IKNLSKLSML | | SIRENKIKQL | | PAEIGELCNL | | ITLDVAHNQL |
EHLPKEIGNC | | TQITNLDLQH | | NELLDLPDTI | | GNLSSLSRLG | | LRYNRLSAIP |
RSLAKCSALE | | ELNLENNNIS | | TLPESLLSSL | | VKLNSLTLAR | | NCFQLYPVGG |
PSQFSTIYSL | | NMEHNRINKI | | PFGIFSRAKV | | LSKLNMKDNQ | | LTSLPLDFGT |
WTSMVELNLA | | TNQLTKIPED | | VSGLVSLEVL | | ILSNNLLKKL | | PHGLGNLRKL |
RELDLEENKL | | ESLPNEIAYL | | KDLQKLVLTN | | NQLTTLPRGI | | GHLTNLTHLG |
LGENLLTHLP | | EEIGTLENLE | | ELYLNDNPNL | | HSLPFELALC | | SKLSIMSIEN |
CPLSHLPPQI | | VAGGPSFIIQ | | FLKMQGPYRA | | MV |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Sieburth D.S., Sun Q., Han M. (1998). SUR-8, a conserved Ras-binding protein with leucine-rich repeats, positively regulates Ras-mediated signaling in C. elegans. Cell. 94: 119—130. PMID 9674433 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81227-1
- Selfors L.M., Schutzman J.L., Borland C.Z., Stern M.J. (1998). Soc-2 encodes a leucine-rich repeat protein implicated in fibroblast growth factor receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 6903—6908. PMID 9618511 DOI:10.1073/pnas.95.12.6903
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dai P., Xiong W.C., Mei L. (2006). Erbin inhibits RAF activation by disrupting the sur-8-Ras-Raf complex. J. Biol. Chem. 281: 927—933. PMID 16301319 DOI:10.1074/jbc.M507360200
- Rodriguez-Viciana P., Oses-Prieto J., Burlingame A., Fried M., McCormick F. (2006). A phosphatase holoenzyme comprised of Shoc2/Sur8 and the catalytic subunit of PP1 functions as an M-Ras effector to modulate Raf activity. Mol. Cell. 22: 217—230. PMID 16630891 DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.027
- Hannig V., Jeoung M., Jang E.R., Phillips J.A. III, Galperin E. (2014). A Novel SHOC2 Variant in Rasopathy. Hum. Mutat. 35: 1290—1294. PMID 25137548 DOI:10.1002/humu.22634
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SHOC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15454 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UQ13 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |