SIGIRR : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SIGIRR

Ідентифікатори

Символи

SIGIRR, TIR8, single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain, IL-1R8, single Ig and TIR domain containing

Зовнішні ІД

OMIM: 605478 MGI: 1344402 HomoloGene: 36399 GeneCards: SIGIRR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана
Біологічний процес	• negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway • acute-phase response • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


59307


24058

Ensembl


ENSG00000185187


ENSMUSG00000025494

UniProt


Q6IA17


Q9JLZ8

RefSeq (мРНК)


NM_001135053 NM_001135054 NM_021805


NM_023059 NM_001355055

RefSeq (білок)


NP_001128525 NP_001128526 NP_068577


NP_075546 NP_001341984

Локус (UCSC)

Хр. 11: 0.41 – 0.42 Mb

Хр. 7: 140.67 – 140.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SIGIRR (англ. Single Ig and TIR domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 45 679^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGVCDRAPD	FLSPSEDQVL	RPALGSSVAL	NCTAWVVSGP	HCSLPSVQWL
KDGLPLGIGG	HYSLHEYSWV	KANLSEVLVS	SVLGVNVTST	EVYGAFTCSI
QNISFSSFTL	QRAGPTSHVA	AVLASLLVLL	ALLLAALLYV	KCRLNVLLWY
QDAYGEVEIN	DGKLYDAYVS	YSDCPEDRKF	VNFILKPQLE	RRRGYKLFLD
DRDLLPRAEP	SADLLVNLSR	CRRLIVVLSD	AFLSRAWCSH	SFREGLCRLL
ELTRRPIFIT	FEGQRRDPAH	PALRLLRQHR	HLVTLLLWRP	GSVTPSSDFW
KEVQLALPRK	VQYRPVEGDP	QTQLQDDKDP	MLILRGRVPE	GRALDSEVDP
DPEGDLGVRG	PVFGEPSAPP	HTSGVSLGES	RSSEVDVSDL	GSRNYSARTD
FYCLVSKDDM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Thomassen E., Renshaw B.R., Sims J.E. (1999). Identification and characterization of SIGIRR, a molecule representing a novel subtype of the IL-1R superfamily. Cytokine. 11: 389—399. PMID 10346978 DOI:10.1006/cyto.1998.0452
Qin J., Qian Y., Yao J., Grace C., Li X. (2005). SIGIRR inhibits interleukin-1 receptor- and toll-like receptor 4-mediated signaling through different mechanisms. J. Biol. Chem. 280: 25233—25241. PMID 15866876 DOI:10.1074/jbc.M501363200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30575 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6IA17 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.