SMAP1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SMAP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CRR

Ідентифікатори

Символи

SMAP1, SMAP-1, small ArfGAP 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611372 MGI: 2138261 HomoloGene: 134676 GeneCards: SMAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• clathrin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of erythrocyte differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


60682


98366

Ensembl


ENSG00000112305


ENSMUSG00000026155

UniProt


Q8IYB5


Q91VZ6

RefSeq (мРНК)


NM_001044305 NM_001281439 NM_001281440 NM_021940


NM_001290683 NM_028534 NM_001357395

RefSeq (білок)


NP_001037770 NP_001268368 NP_001268369 NP_068759


NP_001277612 NP_082810 NP_001344324

Локус (UCSC)

Хр. 6: 70.67 – 70.86 Mb

Хр. 1: 23.88 – 23.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMAP1 (англ. Small ArfGAP 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 50 386^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATRSCREKA	QKLNEQHQLI	LSKLLREEDN	KYCADCEAKG	PRWASWNIGV
FICIRCAGIH	RNLGVHISRV	KSVNLDQWTA	EQIQCMQDMG	NTKARLLYEA
NLPENFRRPQ	TDQAVEFFIR	DKYEKKKYYD	KNAIAITNIS	SSDAPLQPLV
SSPSLQAAVD	KNKLEKEKEK	KKEEKKREKE	PEKPAKPLTA	EKLQKKDQQL
EPKKSTSPKK	AAEPTVDLLG	LDGPAVAPVT	NGNTTVPPLN	DDLDIFGPMI
SNPLPATVMP	PAQGTPSAPA	AATLSTVTSG	DLDLFTEQTT	KSEEVAKKQL
SKDSILSLYG	TGTIQQQSTP	GVFMGPTNIP	FTSQAPAAFQ	GFPSMGVPVP
AAPGLIGNVM	GQSPSMMVGM	PMPNGFMGNA	QTGVMPLPQN	VVGPQGGMVG
QMGAPQSKFG	LPQAQQPQWS	LSQMNQQMAG	MSISSATPTA	GFGQPSSTTA
GWSGSSSGQT	LSTQLWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Marcos I., Borrego S., Rodriguez de Cordoba S., Galan J.J., Antinolo G. (2002). Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SMAP1 gene. Gene. 292: 167—171. PMID 12119110 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00645-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19651 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IYB5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.