SMAP1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/23/Protein_SMAP1_PDB_2crr.png/250px-Protein_SMAP1_PDB_2crr.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMAP1, SMAP-1, small ArfGAP 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611372 MGI: 2138261 HomoloGene: 134676 GeneCards: SMAP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • clathrin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана |
---|
Біологічний процес | • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of erythrocyte differentiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bc/PBB_GE_SMAP1_218137_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SMAP1_218137_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001044305 NM_001281439 NM_001281440 NM_021940 |
| | NM_001290683 NM_028534 NM_001357395 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001037770 NP_001268368 NP_001268369 NP_068759 |
| | NP_001277612 NP_082810 NP_001344324 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 70.67 – 70.86 Mb | Хр. 1: 23.88 – 23.96 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMAP1 (англ. Small ArfGAP 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 50 386[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATRSCREKA | | QKLNEQHQLI | | LSKLLREEDN | | KYCADCEAKG | | PRWASWNIGV |
FICIRCAGIH | | RNLGVHISRV | | KSVNLDQWTA | | EQIQCMQDMG | | NTKARLLYEA |
NLPENFRRPQ | | TDQAVEFFIR | | DKYEKKKYYD | | KNAIAITNIS | | SSDAPLQPLV |
SSPSLQAAVD | | KNKLEKEKEK | | KKEEKKREKE | | PEKPAKPLTA | | EKLQKKDQQL |
EPKKSTSPKK | | AAEPTVDLLG | | LDGPAVAPVT | | NGNTTVPPLN | | DDLDIFGPMI |
SNPLPATVMP | | PAQGTPSAPA | | AATLSTVTSG | | DLDLFTEQTT | | KSEEVAKKQL |
SKDSILSLYG | | TGTIQQQSTP | | GVFMGPTNIP | | FTSQAPAAFQ | | GFPSMGVPVP |
AAPGLIGNVM | | GQSPSMMVGM | | PMPNGFMGNA | | QTGVMPLPQN | | VVGPQGGMVG |
QMGAPQSKFG | | LPQAQQPQWS | | LSQMNQQMAG | | MSISSATPTA | | GFGQPSSTTA |
GWSGSSSGQT | | LSTQLWK |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Marcos I., Borrego S., Rodriguez de Cordoba S., Galan J.J., Antinolo G. (2002). Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SMAP1 gene. Gene. 292: 167—171. PMID 12119110 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00645-5
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19651 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IYB5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |