SMARCD3

Ідентифікатори

Символи

SMARCD3, BAF60C, CRACD3, Rsc6p, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3

Зовнішні ІД

OMIM: 601737 MGI: 1914243 HomoloGene: 2314 GeneCards: SMARCD3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nBAF complex • нуклеоплазма • npBAF complex • клітинне ядро • SWI/SNF complex
Біологічний процес	• positive regulation of neuroblast proliferation • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cardiac right ventricle formation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • heart morphogenesis • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • muscle cell differentiation • nucleosome disassembly • positive regulation of smooth muscle cell differentiation • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • secondary heart field specification • regulation of protein binding • neural retina development • regulation of lipid metabolic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6604


66993

Ensembl


ENSG00000082014


ENSMUSG00000028949

UniProt


Q6STE5


Q6P9Z1

RefSeq (мРНК)


NM_001003801 NM_001003802 NM_003078


NM_025891

RefSeq (білок)


NP_001003801 NP_001003802 NP_003069


NP_080167

Локус (UCSC)

Хр. 7: 151.24 – 151.28 Mb

Хр. 5: 24.8 – 24.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMARCD3 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 55 016^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAADEVAGGA	RKATKSKLFE	FLVHGVRPGM	PSGARMPHQG	APMGPPGSPY
MGSPAVRPGL	APAGMEPARK	RAAPPPGQSQ	AQSQGQPVPT	APARSRSAKR
RKMADKILPQ	RIRELVPESQ	AYMDLLAFER	KLDQTIMRKR	VDIQEALKRP
MKQKRKLRLY	ISNTFNPAKP	DAEDSDGSIA	SWELRVEGKL	LDDPSKQKRK
FSSFFKSLVI	ELDKDLYGPD	NHLVEWHRTP	TTQETDGFQV	KRPGDLSVRC
TLLLMLDYQP	PQFKLDPRLA	RLLGLHTQSR	SAIVQALWQY	VKTNRLQDSH
DKEYINGDKY	FQQIFDCPRL	KFSEIPQRLT	ALLLPPDPIV	INHVISVDPS
DQKKTACYDI	DVEVEEPLKG	QMSSFLLSTA	NQQEISALDS	KIHETIESIN
QLKIQRDFML	SFSRDPKGYV	QDLLRSQSRD	LKVMTDVAGN	PEEERRAEFY
HQPWSQEAVS	RYFYCKIQQR	RQELEQSLVV	RNT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11108 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6STE5 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.