SMC2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, structural maintenance of chromosomes 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 GeneCards: SMC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ATP binding • single-stranded DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • хромосома • нуклеоплазма • Конденсин • nuclear chromosome • ядерце • екзосома • condensed chromosome • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • kinetochore organization • meiotic chromosome condensation • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • meiotic chromosome segregation • поділ клітини • chromosome condensation • клітинний цикл • mitotic chromosome condensation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/PBB_GE_SMC2_213253_at_fs.png/250px-PBB_GE_SMC2_213253_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/65/PBB_GE_SMC2_204240_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SMC2_204240_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001042550 NM_001042551 NM_001265602 NM_006444 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001036015 NP_001036016 NP_001252531 NP_006435 NP_006435.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 104.09 – 104.14 Mb | Хр. 4: 52.44 – 52.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMC2 (англ. Structural maintenance of chromosomes 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 197 амінокислот, а молекулярна маса — 135 656[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHIKSIILEG | | FKSYAQRTEV | | NGFDPLFNAI | | TGLNGSGKSN | | ILDSICFLLG |
ISNLSQVRAS | | NLQDLVYKNG | | QAGITKASVS | | ITFDNSDKKQ | | SPLGFEVHDE |
ITVTRQVVIG | | GRNKYLINGV | | NANNTRVQDL | | FCSVGLNVNN | | PHFLIMQGRI |
TKVLNMKPPE | | ILSMIEEAAG | | TRMYEYKKIA | | AQKTIEKKEA | | KLKEIKTILE |
EEITPTIQKL | | KEERSSYLEY | | QKVMREIEHL | | SRLYIAYQFL | | LAEDTKVRSA |
EELKEMQDKV | | IKLQEELSEN | | DKKIKALNHE | | IEELEKRKDK | | ETGGILRSLE |
DALAEAQRVN | | TKSQSAFDLK | | KKNLACEESK | | RKELEKNMVE | | DSKTLAAKEK |
EVKKITDGLH | | ALQEASNKDA | | EALAAAQQHF | | NAVSAGLSSN | | EDGAEATLAG |
QMMACKNDIS | | KAQTEAKQAQ | | MKLKHAQQEL | | KNKQAEVKKM | | DSGYRKDQEA |
LEAVKRLKEK | | LEAEMKKLNY | | EENKEESLLE | | KRRQLSRDIG | | RLKETYEALL |
ARFPNLRFAY | | KDPEKNWNRN | | CVKGLVASLI | | SVKDTSATTA | | LELVAGERLY |
NVVVDTEVTG | | KKLLERGELK | | RRYTIIPLNK | | ISARCIAPET | | LRVAQNLVGP |
DNVHVALSLV | | EYKPELQKAM | | EFVFGTTFVC | | DNMDNAKKVA | | FDKRIMTRTV |
TLGGDVFDPH | | GTLSGGARSQ | | AASILTKFQE | | LKDVQDELRI | | KENELRALEE |
ELAGLKNTAE | | KYRQLKQQWE | | MKTEEADLLQ | | TKLQQSSYHK | | QQEELDALKK |
TIEESEETLK | | NTKEIQRKAE | | EKYEVLENKM | | KNAEAERERE | | LKDAQKKLDC |
AKTKADASSK | | KMKEKQQEVE | | AITLELEELK | | REHTSYKQQL | | EAVNEAIKSY |
ESQIEVMAAE | | VAKNKESVNK | | AQEEVTKQKE | | VITAQDTVIK | | AKYAEVAKHK |
EQNNDSQLKI | | KELDHNISKH | | KREAEDGAAK | | VSKMLKDYDW | | INAERHLFGQ |
PNSAYDFKTN | | NPKEAGQRLQ | | KLQEMKEKLG | | RNVNMRAMNV | | LTEAEERYND |
LMKKKRIVEN | | DKSKILTTIE | | DLDQKKNQAL | | NIAWQKVNKD | | FGSIFSTLLP |
GANAMLAPPE | | GQTVLDGLEF | | KVALGNTWKE | | NLTELSGGQR | | SLVALSLILS |
MLLFKPAPIY | | ILDEVDAALD | | LSHTQNIGQM | | LRTHFTHSQF | | IVVSLKEGMF |
NNANVLFKTK | | FVDGVSTVAR | | FTQCQNGKIS | | KEAKSKAKPP | | KGAHVEV |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications. Mol. Biol. Evol. 21: 332—347. PMID 14660695 DOI:10.1093/molbev/msh023
- Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
- Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14011 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95347 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |