SMOC2

Ідентифікатори

Символи

SMOC2, DTDP1, MST117, MSTP117, MSTP140, SMAP2, bA270C4A.1, bA37D8.1, dJ421D16.1, SPARC related modular calcium binding 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607223 MGI: 1929881 HomoloGene: 11150 GeneCards: SMOC2

Пов'язані генетичні захворювання

вітиліго^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • heparin binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• extracellular region • базальна мембрана • interstitial matrix • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • cell periphery • GO:0005578 Позаклітинна матриця
Біологічний процес	• extracellular matrix organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell-substrate adhesion • positive regulation of endothelial cell migration • positive regulation of vascular wound healing • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • positive regulation of DNA biosynthetic process • positive regulation of endothelial cell chemotaxis • positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64094


64074

Ensembl


ENSG00000112562


ENSMUSG00000023886

UniProt


Q9H3U7


Q8CD91

RefSeq (мРНК)


NM_001166412 NM_022138


NM_022315

RefSeq (білок)


NP_001159884 NP_071421


NP_071710

Локус (UCSC)

Хр. 6: 168.44 – 168.67 Mb

Хр. 17: 14.5 – 14.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMOC2 (англ. SPARC related modular calcium binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 49 674^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLPQLCWLP	LLAGLLPPVP	AQKFSALTFL	RVDQDKDKDC	SLDCAGSPQK
PLCASDGRTF	LSRCEFQRAK	CKDPQLEIAY	RGNCKDVSRC	VAERKYTQEQ
ARKEFQQVFI	PECNDDGTYS	QVQCHSYTGY	CWCVTPNGRP	ISGTAVAHKT
PRCPGSVNEK	LPQREGTGKT	DDAAAPALET	QPQGDEEDIA	SRYPTLWTEQ
VKSRQNKTNK	NSVSSCDQEH	QSALEEAKQP	KNDNVVIPEC	AHGGLYKPVQ
CHPSTGYCWC	VLVDTGRPIP	GTSTRYEQPK	CDNTARAHPA	KARDLYKGRQ
LQGCPGAKKH	EFLTSVLDAL	STDMVHAASD	PSSSSGRLSE	PDPSHTLEER
VVHWYFKLLD	KNSSGDIGKK	EIKPFKRFLR	KKSKPKKCVK	KFVEYCDVNN
DKSISVQELM	GCLGVAKEDG	KADTKKRHTP	RGHAESTSNR	QPRKQG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vannahme C., Goesling S., Paulsson M., Maurer P., Hartmann U. (2003). Characterization of SMOC-2, a modular extracellular calcium-binding protein. Biochem. J. 373: 805—814. PMID 12741954 DOI:10.1042/BJ20030532
Rocnik E.F., Liu P., Sato K., Walsh K., Vaziri C. (2006). The novel SPARC family member SMOC-2 potentiates angiogenic growth factor activity. J. Biol. Chem. 281: 22855—22864. PMID 16774925 DOI:10.1074/jbc.M513463200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMOC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20323 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H3U7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 6 вересня 2017.