SNX18

Ідентифікатори

Символи

SNX18, SH3PX2, SH3PXD3B, SNAG1, sorting nexin 18

Зовнішні ІД

MGI: 2137642 HomoloGene: 14164 GeneCards: SNX18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • lipid binding
Клітинна компонента	• мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • система ендомембран • clathrin-coated vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендосома
Біологічний процес	• cleavage furrow formation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein transport • клітинний цикл • ендоцитоз • mitotic cytokinesis • GO:0007067 мітоз • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


112574


170625

Ensembl


ENSG00000178996


ENSMUSG00000042364

UniProt


Q96RF0


Q91ZR2 Q8C788

RefSeq (мРНК)


NM_052870 NM_001102575 NM_001145427


NM_130796

RefSeq (білок)


NP_001096045 NP_001138899 NP_443102


NP_570614

Локус (UCSC)

Хр. 5: 54.52 – 54.55 Mb

Хр. 13: 113.73 – 113.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX18 (англ. Sorting nexin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 628 амінокислот, а молекулярна маса — 68 894^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRARALYD	FRSENPGEIS	LREHEVLSLC	SEQDIEGWLE	GVNSRGDRGL
FPASYVQVIR	APEPGPAGDG	GPGAPARYAN	VPPGGFEPLP	VAPPASFKPP
PDAFQALLQP	QQAPPPSTFQ	PPGAGFPYGG	GALQPSPQQL	YGGYQASQGS
DDDWDDEWDD	SSTVADEPGA	LGSGAYPDLD	GSSSAGVGAA	GRYRLSTRSD
LSLGSRGGSV	PPQHHPSGPK	SSATVSRNLN	RFSTFVKSGG	EAFVLGEASG
FVKDGDKLCV	VLGPYGPEWQ	ENPYPFQCTI	DDPTKQTKFK	GMKSYISYKL
VPTHTQVPVH	RRYKHFDWLY	ARLAEKFPVI	SVPHLPEKQA	TGRFEEDFIS
KRRKGLIWWM	NHMASHPVLA	QCDVFQHFLT	CPSSTDEKAW	KQGKRKAEKD
EMVGANFFLT	LSTPPAAALD	LQEVESKIDG	FKCFTKKMDD	SALQLNHTAN
EFARKQVTGF	KKEYQKVGQS	FRGLSQAFEL	DQQAFSVGLN	QAIAFTGDAY
DAIGELFAEQ	PRQDLDPVMD	LLALYQGHLA	NFPDIIHVQK	GKAWPLEQVI
WSVLCRLKGA	TLTAVPLWVS	ESYSTGEEAS	RDVDAWVFSL	ECKLDCSTGS
FLLEYLALGN	EYSFSKVQRV	PLMTVLSF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Haberg K., Lundmark R., Carlsson S.R. (2008). SNX18 is an SNX9 paralog that acts as a membrane tubulator in AP-1-positive endosomal trafficking. J. Cell Sci. 121: 1495—1505. PMID 18411244 DOI:10.1242/jcs.028530
Baumann C., Lindholm C.K., Rimoldi D., Levy F. (2010). The E3 ubiquitin ligase Itch regulates sorting nexin 9 through an unconventional substrate recognition domain. FEBS J. 277: 2803—2814. PMID 20491914 DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07698.x
Ma M.P., Chircop M. (2012). SNX9, SNX18 and SNX33 are required for progression through and completion of mitosis. J. Cell Sci. 125: 4372—4382. PMID 22718350 DOI:10.1242/jcs.105981

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19245 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96RF0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.