SORBS3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CT3, 2DLM, 2NWM, 2YUP

Ідентифікатори

Символи

SORBS3, SCAM-1, SCAM1, SH3D4, sorbin and SH3 domain containing 3

Зовнішні ІД

OMIM: 610795 MGI: 700013 HomoloGene: 4218 GeneCards: SORBS3

Пов'язані генетичні захворювання

ВІЛ-заворювання^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• vinculin binding • transcription factor binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • міжклітинні контакти • цитоскелет • клітинне ядро • focal adhesion
Біологічний процес	• cell-substrate adhesion • адгезія клітин • м'язове скорочення • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of cytoskeleton organization • positive regulation of MAPK cascade • actin filament organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10174


20410

Ensembl


ENSG00000120896


ENSMUSG00000022091

UniProt


O60504


Q9R1Z8

RefSeq (мРНК)


NM_001018003 NM_005775


NM_001271407 NM_001271408 NM_001271409 NM_011366

RefSeq (білок)


NP_001018003 NP_005766


NP_001258336 NP_001258337 NP_001258338 NP_035496

Локус (UCSC)

Хр. 8: 22.54 – 22.58 Mb

Хр. 14: 70.42 – 70.45 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SORBS3 (англ. Sorbin and SH3 domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 75 341^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQGPPRSLRA	GLSLDDFIPG	HLQSHIGSSS	RGTRVPVIRN	GGSNTLNFQF
HDPAPRTVCN	GGYTPRRDAS	QHPDPAWYQT	WPGPGSKPSA	STKIPASQHT
QNWSATWTKD	SKRRDKRWVK	YEGIGPVDES	GMPIAPRSSV	DRPRDWYRRM
FQQIHRKMPD	LQLDWTFEEP	PRDPRHLGAQ	QRPAHRPGPA	TSSSGRSWDH
SEELPRSTFN	YRPGAFSTVL	QPSNQVLRRR	EKVDNVWTEE	SWNQFLQELE
TGQRPKKPLV	DDPGEKPSQP	IEVLLERELA	ELSAELDKDL	RAIETRLPSP
KSSPAPRRAP	EQRPPAGPAS	AWSSSYPHAP	YLGSARSLSP	HKMADGGSPF
LGRRDFVYPS	STRDPSASNG	GGSPARREEK	KRKAARLKFD	FQAQSPKELT
LQKGDIVYIH	KEVDKNWLEG	EHHGRLGIFP	ANYVEVLPAD	EIPKPIKPPT
YQVLEYGEAV	AQYTFKGDLE	VELSFRKGEH	ICLIRKVNEN	WYEGRITGTG
RQGIFPASYV	QVSREPRLRL	CDDGPQLPTS	PRLTAAARSA	RHPSSPSALR
SPADPIDLGG	QTSPRRTGFS	FPTQEPRPQT	QNLGTPGPAL	SHSRGPSHPL
DLGTSSPNTS	QIHWTPYRAM	YQYRPQNEDE	LELREGDRVD	VMQQCDDGWF
VGVSRRTQKF	GTFPGNYVAP	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SORBS3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30907 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O60504 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.