SPI1

SPI1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1PUE

Ідентифікатори
Символи SPI1, OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1 proto-oncogene, AGM10
Зовнішні ІД OMIM: 165170 MGI: 98282 HomoloGene: 2346 GeneCards: SPI1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
RNA binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
NFAT protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
transcription regulator complex

Біологічний процес

myeloid leukocyte differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to ethanol
somatic stem cell population maintenance
lymphocyte differentiation
regulation of erythrocyte differentiation
myeloid dendritic cell differentiation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of MHC class II biosynthetic process
lymphoid progenitor cell differentiation
transcription, DNA-templated
macrophage differentiation
anatomical structure regression
negative regulation of histone H4 acetylation
negative regulation of gene expression, epigenetic
vasculature development
granulocyte differentiation
apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis
histone H3 acetylation
erythrocyte differentiation
hypermethylation of CpG island
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
диференціація клітин
interleukin-6-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6688
20375
Ensembl
ENSG00000066336
ENSMUSG00000002111
UniProt
P17947
P17433
RefSeq (мРНК)
NM_001080547
NM_003120
NM_011355
NM_001378898
NM_001378899
RefSeq (білок)
NP_001074016
NP_003111
NP_035485
NP_001365827
NP_001365828
Локус (UCSC) Хр. 11: 47.35 – 47.38 Mb Хр. 2: 90.91 – 90.95 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPI1 (англ. Spi-1 proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 31 083[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLQACKMEGFPLVPPPSEDLVPYDTDLYQRQTHEYYPYLSSDGESHSDHY
WDFHPHHVHSEFESFAENNFTELQSVQPPQLQQLYRHMELEQMHVLDTPM
VPPHPSLGHQVSYLPRMCLQYPSLSPAQPSSDEEEGERQSPPLEVSDGEA
DGLEPGPGLLPGETGSKKKIRLYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQ
FSSKHKEALAHRWGIQKGNRKKMTYQKMARALRNYGKTGEVKKVKKKLTY
QFSGEVLGRGGLAERRHPPH

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 DOI:10.1074/jbc.274.16.11115
  • Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. (1999). Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias. Mol. Cell. Biol. 19: 3635—3644. PMID 10207087 DOI:10.1128/MCB.19.5.3635
  • Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 DOI:10.1074/jbc.M607613200
  • Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). The human homologue of the putative proto-oncogene Spi-1: characterization and expression in tumors. Oncogene. 5: 663—668. PMID 1693183
  • Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). Oncogene. 5: 1611—1612. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11241 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P17947 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»