SPIN1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SPIN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2NS2, 4H75, 4MZF, 4MZG, 4MZH

Ідентифікатори

Символи

SPIN1, SPIN, TDRD24, spindlin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609936 MGI: 109242 HomoloGene: 55983 GeneCards: SPIN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • веретено поділу • ядерце • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерна мембрана
Біологічний процес	• multicellular organism development • Wnt signaling pathway • клітинний цикл • GO:0007126 мейоз • rRNA transcription • gamete generation • positive regulation of Wnt signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10927


20729

Ensembl


ENSG00000106723


ENSMUSG00000021395

UniProt


Q9Y657


Q61142

RefSeq (мРНК)


NM_006717


NM_001283028 NM_001283029 NM_001283030 NM_011462 NM_146043

RefSeq (білок)


NP_006708


NP_001269957 NP_001269958 NP_001269959 NP_035592 NP_666155

Локус (UCSC)

Хр. 9: 88.39 – 88.48 Mb

Хр. 13: 51.25 – 51.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPIN1 (англ. Spindlin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 262 амінокислот, а молекулярна маса — 29 601^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKTPFGKTPG	QRSRADAGHA	GVSANMMKKR	TSHKKHRSSV	GPSKPVSQPR
RNIVGCRIQH	GWKEGNGPVT	QWKGTVLDQV	PVNPSLYLIK	YDGFDCVYGL
ELNKDERVSA	LEVLPDRVAT	SRISDAHLAD	TMIGKAVEHM	FETEDGSKDE
WRGMVLARAP	VMNTWFYITY	EKDPVLYMYQ	LLDDYKEGDL	RIMPDSNDSP
PAEREPGEVV	DSLVGKQVEY	AKEDGSKRTG	MVIHQVEAKP	SVYFIKFDDD
FHIYVYDLVK	TS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, сигнальний шлях Wnt, мейоз, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11243 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y657 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.