SPINK1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/Protein_SPINK1_PDB_1cgi.png/250px-Protein_SPINK1_PDB_1cgi.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1CGI, 1CGJ, 1HPT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPINK1, PCTT, PSTI, Spink3, TATI, TCP, serine peptidase inhibitor, Kazal type 1, serine peptidase inhibitor Kazal type 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 167790 MGI: 106202 HomoloGene: 68300 GeneCards: SPINK1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хронічний панкреатит[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • endopeptidase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • serine-type endopeptidase inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • Акросома • екзосома • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of nitric oxide mediated signal transduction • regulation of acrosome reaction • negative regulation of peptidase activity • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of serine-type endopeptidase activity • regulation of store-operated calcium entry • negative regulation of calcium ion import • sperm capacitation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1f/PBB_GE_SPINK1_206239_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SPINK1_206239_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_003122 NM_001354966 NM_001379610 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_003113 NP_001341895 NP_001366539 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 147.82 – 147.83 Mb | Хр. 18: 43.86 – 43.87 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPINK1 (англ. Serine peptidase inhibitor, Kazal type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 79 амінокислот, а молекулярна маса — 8 507[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKVTGIFLLS | | ALALLSLSGN | | TGADSLGREA | | KCYNELNGCT | | KIYDPVCGTD |
GNTYPNECVL | | CFENRKRQTS | | ILIQKSGPC |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм. Секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bartelt D.C., Shapanka R., Greene L.J. (1977). The primary structure of the human pancreatic secretory trypsin inhibitor. Amino acid sequence of the reduced S-aminoethylated protein. Arch. Biochem. Biophys. 179: 189—199. PMID 843082 DOI:10.1016/0003-9861(77)90103-5
- Hecht H.-J., Szardenings M., Collins J., Schomburg D. (1992). Three-dimensional structure of a recombinant variant of human pancreatic secretory trypsin inhibitor (Kazal type). J. Mol. Biol. 225: 1095—1103. PMID 1613792 DOI:10.1016/0022-2836(92)90107-U
- Klaus W., Schomburg D. (1993). Solution structure of a variant of human pancreatic secretory trypsin inhibitor determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy. J. Mol. Biol. 229: 695—706. PMID 8433367 DOI:10.1006/jmbi.1993.1073
- Chen J.-M., Mercier B., Audrezet M.-P., Ferec C. (2000). Mutational analysis of the human pancreatic secretory trypsin inhibitor (PSTI) gene in hereditary and sporadic chronic pancreatitis. J. Med. Genet. 37: 67—69. PMID 10691414 DOI:10.1136/jmg.37.1.67
- Aoun E., Muddana V., Papachristou G.I., Whitcomb D.C. (2010). SPINK1 N34S is strongly associated with recurrent acute pancreatitis but is not a risk factor for the first or sentinel acute pancreatitis event. Am. J. Gastroenterol. 105: 446—451. PMID 19888199 DOI:10.1038/ajg.2009.630
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPINK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11244 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P00995 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |