SPOCK1

Ідентифікатори

Символи

SPOCK1, SPOCK, TESTICAN, TIC1, sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 1, SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1, SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602264 MGI: 105371 HomoloGene: 80193 GeneCards: SPOCK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • metalloendopeptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity • collagen binding • extracellular matrix binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • neuromuscular junction • node of Ranvier • extracellular region • Саркоплазма • міжклітинний простір
Біологічний процес	• negative regulation of cell-substrate adhesion • Нейрогенез • negative regulation of neuron projection development • neuron migration • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • regulation of cell growth • central nervous system neuron differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of endopeptidase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6695


20745

Ensembl


ENSG00000152377


ENSMUSG00000056222

UniProt


Q08629


Q62288

RefSeq (мРНК)


NM_004598


NM_001166463 NM_001166464 NM_001166465 NM_001166466 NM_009262

RefSeq (білок)


NP_004589


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 136.98 – 137.6 Mb

Хр. 13: 57.57 – 58.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPOCK1 (англ. SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 124^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAIAVLAAA	AAAWCFLQVE	SRHLDALAGG	AGPNHGNFLD	NDQWLSTVSQ
YDRDKYWNRF	RDDDYFRNWN	PNKPFDQALD	PSKDPCLKVK	CSPHKVCVTQ
DYQTALCVSR	KHLLPRQKKG	NVAQKHWVGP	SNLVKCKPCP	VAQSAMVCGS
DGHSYTSKCK	LEFHACSTGK	SLATLCDGPC	PCLPEPEPPK	HKAERSACTD
KELRNLASRL	KDWFGALHED	ANRVIKPTSS	NTAQGRFDTS	ILPICKDSLG
WMFNKLDMNY	DLLLDPSEIN	AIYLDKYEPC	IKPLFNSCDS	FKDGKLSNNE
WCYCFQKPGG	LPCQNEMNRI	QKLSKGKSLL	GAFIPRCNEE	GYYKATQCHG
STGQCWCVDK	YGNELAGSRK	QGAVSCEEEQ	ETSGDFGSGG	SVVLLDDLEY
ERELGPKDKE	GKLRVHTRAV	TEDDEDEDDD	KEDEVGYIW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Alliel P.M., Perin J.-P., Jolles P., Bonnet F.J. (1993). Testican, a multidomain testicular proteoglycan resembling modulators of cell social behaviour. Eur. J. Biochem. 214: 347—350. PMID 8389704 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb17930.x
Marr H.S., Basalamah M.A., Edgell C.J. (1997). Endothelial cell expression of testican mRNA. Endothelium. 5: 209—219. PMID 9272383 DOI:10.3109/10623329709053399
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bonnet F., Perin J.-P., Maillet P., Jolles P., Alliel P.M. (1992). Characterization of a human seminal plasma glycosaminoglycan-bearing polypeptide. Biochem. J. 288: 565—569. PMID 1463459 DOI:10.1042/bj2880565
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11251 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q08629 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.