SPRTN |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPRTN, C1orf124, DDDL1880, DVC1, PRO4323, Spartan, dJ876B10.3, SprT-like N-terminal domain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616086 MGI: 2685351 HomoloGene: 32764 GeneCards: SPRTN |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
progeroid features-hepatocellular carcinoma predisposition syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома |
---|
Біологічний процес | • error-free translesion synthesis • positive regulation of protein ubiquitination • response to UV • cellular response to DNA damage stimulus • translesion synthesis • GO:0100026 Репарація ДНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001010984 NM_001261462 NM_032018 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001010984 NP_001248391 NP_114407 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 231.34 – 231.36 Mb | Хр. 8: 125.62 – 125.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPRTN (англ. SprT-like N-terminal domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 55 134[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDDDLMLALR | | LQEEWNLQEA | | ERDHAQESLS | | LVDASWELVD | | PTPDLQALFV |
QFNDQFFWGQ | | LEAVEVKWSV | | RMTLCAGICS | | YEGKGGMCSI | | RLSEPLLKLR |
PRKDLVETLL | | HEMIHAYLFV | | TNNDKDREGH | | GPEFCKHMHR | | INSLTGANIT |
VYHTFHDEVD | | EYRRHWWRCN | | GPCQHRPPYY | | GYVKRATNRE | | PSAHDYWWAE |
HQKTCGGTYI | | KIKEPENYSK | | KGKGKAKLGK | | EPVLAAENKD | | KPNRGEAQLV |
IPFSGKGYVL | | GETSNLPSPG | | KLITSHAINK | | TQDLLNQNHS | | ANAVRPNSKI |
KVKFEQNGSS | | KNSHLVSPAV | | SNSHQNVLSN | | YFPRVSFANQ | | KAFRGVNGSP |
RISVTVGNIP | | KNSVSSSSQR | | RVSSSKISLR | | NSSKVTESAS | | VMPSQDVSGS |
EDTFPNKRPR | | LEDKTVFDNF | | FIKKEQIKSS | | GNDPKYSTTT | | AQNSSSSSSQ |
SKMVNCPVCQ | | NEVLESQINE | | HLDWCLEGDS | | IKVKSEESL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Machida Y., Kim M.S., Machida Y.J. (2012). Spartan/C1orf124 is important to prevent UV-induced mutagenesis. Cell Cycle. 11: 3395—3402. PMID 22894931 DOI:10.4161/cc.21694
- Ghosal G., Leung J.W., Nair B.C., Fong K.W., Chen J. (2012). Proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding protein C1orf124 is a regulator of translesion synthesis. J. Biol. Chem. 287: 34225—34233. PMID 22902628 DOI:10.1074/jbc.M112.400135
- Centore R.C., Yazinski S.A., Tse A., Zou L. (2012). Spartan/C1orf124, a reader of PCNA ubiquitylation and a regulator of UV-induced DNA damage response. Mol. Cell. 46: 625—635. PMID 22681887 DOI:10.1016/j.molcel.2012.05.020
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPRTN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25356 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H040 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |