SPSB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JK9, 3F2O

Ідентифікатори

Символи

SPSB1, SSB-1, SSB1, splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611657 MGI: 1921896 HomoloGene: 11832 GeneCards: SPSB1

Пов'язані генетичні захворювання

сибірка, ревматоїдний артрит^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80176


74646

Ensembl


ENSG00000171621


ENSMUSG00000039911

UniProt


Q96BD6


Q9D5L7

RefSeq (мРНК)


NM_025106


NM_029035

RefSeq (білок)


NP_079382


NP_083311

Локус (UCSC)

Хр. 1: 9.29 – 9.37 Mb

Хр. 4: 149.98 – 150.04 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPSB1 (англ. SplA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 942^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGQKVTGGIK	TVDMRDPTYR	PLKQELQGLD	YCKPTRLDLL	LDMPPVSYDV
QLLHSWNNND	RSLNVFVKED	DKLIFHRHPV	AQSTDAIRGK	VGYTRGLHVW
QITWAMRQRG	THAVVGVATA	DAPLHSVGYT	TLVGNNHESW	GWDLGRNRLY
HDGKNQPSKT	YPAFLEPDET	FIVPDSFLVA	LDMDDGTLSF	IVDGQYMGVA
FRGLKGKKLY	PVVSAVWGHC	EIRMRYLNGL	DPEPLPLMDL	CRRSVRLALG
RERLGEIHTL	PLPASLKAYL	LYQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang D., Li Z., Messing E.M., Wu G. (2005). The SPRY domain-containing SOCS box protein 1 (SSB-1) interacts with MET and enhances the hepatocyte growth factor-induced Erk-Elk-1-serum response element pathway. J. Biol. Chem. 280: 16393—16401. PMID 15713673 DOI:10.1074/jbc.M413897200
Woo J.S., Suh H.Y., Park S.Y., Oh B.H. (2006). Structural basis for protein recognition by B30.2/SPRY domains. Mol. Cell. 24: 967—976. PMID 17189197 DOI:10.1016/j.molcel.2006.11.009

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPSB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30628 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96BD6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.