SPSB1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cb/Protein_SPSB1_PDB_2JK9.png/250px-Protein_SPSB1_PDB_2JK9.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JK9, 3F2O | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPSB1, SSB-1, SSB1, splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611657 MGI: 1921896 HomoloGene: 11832 GeneCards: SPSB1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
сибірка, ревматоїдний артрит[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex |
---|
Біологічний процес | • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/ad/PBB_GE_SPSB1_219677_at_fs.png/250px-PBB_GE_SPSB1_219677_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 9.29 – 9.37 Mb | Хр. 4: 149.98 – 150.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPSB1 (англ. SplA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 942[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGQKVTGGIK | | TVDMRDPTYR | | PLKQELQGLD | | YCKPTRLDLL | | LDMPPVSYDV |
QLLHSWNNND | | RSLNVFVKED | | DKLIFHRHPV | | AQSTDAIRGK | | VGYTRGLHVW |
QITWAMRQRG | | THAVVGVATA | | DAPLHSVGYT | | TLVGNNHESW | | GWDLGRNRLY |
HDGKNQPSKT | | YPAFLEPDET | | FIVPDSFLVA | | LDMDDGTLSF | | IVDGQYMGVA |
FRGLKGKKLY | | PVVSAVWGHC | | EIRMRYLNGL | | DPEPLPLMDL | | CRRSVRLALG |
RERLGEIHTL | | PLPASLKAYL | | LYQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang D., Li Z., Messing E.M., Wu G. (2005). The SPRY domain-containing SOCS box protein 1 (SSB-1) interacts with MET and enhances the hepatocyte growth factor-induced Erk-Elk-1-serum response element pathway. J. Biol. Chem. 280: 16393—16401. PMID 15713673 DOI:10.1074/jbc.M413897200
- Woo J.S., Suh H.Y., Park S.Y., Oh B.H. (2006). Structural basis for protein recognition by B30.2/SPRY domains. Mol. Cell. 24: 967—976. PMID 17189197 DOI:10.1016/j.molcel.2006.11.009
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPSB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30628 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q96BD6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |