SRSF11 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SRSF11, NET2, SFRS11, dJ677H15.2, p54, serine/arginine-rich splicing factor 11, serine and arginine rich splicing factor 11 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602010 MGI: 1916457 HomoloGene: 36164 GeneCards: SRSF11 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4c/PBB_GE_SFRS11_200686_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS11_200686_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/PBB_GE_SFRS11_200685_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS11_200685_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001190987 NM_004768 NM_001350605 NM_001350606 NM_001350607
| NM_001350608 NM_001350609 NM_001350610 NM_001350611 NM_001350612 NM_001350613 NM_001350614 NM_001350615 NM_001350616 NM_001394402 NM_001394403 NM_001394404 NM_001394405 NM_001394406 NM_001394407 NM_001394408 |
| | NM_001093752 NM_001093753 NM_026989 NM_001356997 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001177916 NP_004759 NP_001337534 NP_001337535 NP_001337536
| NP_001337537 NP_001337538 NP_001337539 NP_001337540 NP_001337541 NP_001337542 NP_001337543 NP_001337544 NP_001337545 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 70.21 – 70.25 Mb | Хр. 3: 158.01 – 158.04 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SRSF11 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 53 542[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSNTTVVPST | | AGPGPSGGPG | | GGGGGGGGGG | | GTEVIQVTNV | | SPSASSEQMR |
TLFGFLGKID | | ELRLFPPDDS | | PLPVSSRVCF | | VKFHDPDSAV | | VAQHLTNTVF |
VDRALIVVPY | | AEGVIPDEAK | | ALSLLAPANA | | VAGLLPGGGL | | LPTPNPLTQI |
GAVPLAALGA | | PTLDPALAAL | | GLPGANLNSQ | | SLAADQLLKL | | MSTVDPKLNH |
VAAGLVSPSL | | KSDTSSKEIE | | EAMKRVREAQ | | SLISAAIEPD | | KKEEKRRHSR |
SRSRSRRRRT | | PSSSRHRRSR | | SRSRRRSHSK | | SRSRRRSKSP | | RRRRSHSRER |
GRRSRSTSKT | | RDKKKEDKEK | | KRSKTPPKSY | | STARRSRSAS | | RERRRRRSRS |
GTRSPKKPRS | | PKRKLSRSPS | | PRRHKKEKKK | | DKDKERSRDE | | RERSTSKKKK |
SKDKEKDRER | | KSESDKDVKQ | | VTRDYDEEEQ | | GYDSEKEKKE | | EKKPIETGSP |
KTKECSVEKG | | TGDSLRESKV | | NGDDHHEEDM | | DMSD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Див. також
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10782 (англ.). Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q05519 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Література
- Chaudhary N., McMahon C., Blobel G. (1991). Primary structure of a human arginine-rich nuclear protein that colocalizes with spliceosome components. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 8189—8193. PMID 1896467 DOI:10.1073/pnas.88.18.8189
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Page-McCaw P.S., Amonlirdviman K., Sharp P.A. (1999). PUF60: a novel U2AF65-related splicing activity. RNA. 5: 1548—1560. PMID 10606266 DOI:10.1017/S1355838299991938
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |