SRSF11

Ідентифікатори

Символи

SRSF11, NET2, SFRS11, dJ677H15.2, p54, serine/arginine-rich splicing factor 11, serine and arginine rich splicing factor 11

Зовнішні ІД

OMIM: 602010 MGI: 1916457 HomoloGene: 36164 GeneCards: SRSF11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9295


69207

Ensembl


ENSG00000116754


ENSMUSG00000055436

UniProt


Q05519 Q5T757


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001190987 NM_004768 NM_001350605 NM_001350606 NM_001350607
NM_001350608 NM_001350609 NM_001350610 NM_001350611 NM_001350612 NM_001350613 NM_001350614 NM_001350615 NM_001350616 NM_001394402 NM_001394403 NM_001394404 NM_001394405 NM_001394406 NM_001394407 NM_001394408


NM_001093752 NM_001093753 NM_026989 NM_001356997

RefSeq (білок)

NP_001177916 NP_004759 NP_001337534 NP_001337535 NP_001337536
NP_001337537 NP_001337538 NP_001337539 NP_001337540 NP_001337541 NP_001337542 NP_001337543 NP_001337544 NP_001337545


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 70.21 – 70.25 Mb

Хр. 3: 158.01 – 158.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRSF11 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 53 542^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNTTVVPST	AGPGPSGGPG	GGGGGGGGGG	GTEVIQVTNV	SPSASSEQMR
TLFGFLGKID	ELRLFPPDDS	PLPVSSRVCF	VKFHDPDSAV	VAQHLTNTVF
VDRALIVVPY	AEGVIPDEAK	ALSLLAPANA	VAGLLPGGGL	LPTPNPLTQI
GAVPLAALGA	PTLDPALAAL	GLPGANLNSQ	SLAADQLLKL	MSTVDPKLNH
VAAGLVSPSL	KSDTSSKEIE	EAMKRVREAQ	SLISAAIEPD	KKEEKRRHSR
SRSRSRRRRT	PSSSRHRRSR	SRSRRRSHSK	SRSRRRSKSP	RRRRSHSRER
GRRSRSTSKT	RDKKKEDKEK	KRSKTPPKSY	STARRSRSAS	RERRRRRSRS
GTRSPKKPRS	PKRKLSRSPS	PRRHKKEKKK	DKDKERSRDE	RERSTSKKKK
SKDKEKDRER	KSESDKDVKQ	VTRDYDEEEQ	GYDSEKEKKE	EKKPIETGSP
KTKECSVEKG	TGDSLRESKV	NGDDHHEEDM	DMSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Див. також

Хромосома 1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10782 (англ.). Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q05519 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Література

Chaudhary N., McMahon C., Blobel G. (1991). Primary structure of a human arginine-rich nuclear protein that colocalizes with spliceosome components. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 8189—8193. PMID 1896467 DOI:10.1073/pnas.88.18.8189
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Page-McCaw P.S., Amonlirdviman K., Sharp P.A. (1999). PUF60: a novel U2AF65-related splicing activity. RNA. 5: 1548—1560. PMID 10606266 DOI:10.1017/S1355838299991938