SRSF3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2I38

Ідентифікатори

Символи

SRSF3, SFRS3, SRp20, serine/arginine-rich splicing factor 3, serine and arginine rich splicing factor 3

Зовнішні ІД

OMIM: 603364 MGI: 98285 HomoloGene: 55708 GeneCards: SRSF3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • sequence-specific mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • mRNA transport • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6428


20383

Ensembl


ENSG00000112081


ENSMUSG00000071172

UniProt


P84103


P84104

RefSeq (мРНК)


NM_003017


NM_013663

RefSeq (білок)


NP_003008


NP_038691

Локус (UCSC)

Хр. 6: 36.59 – 36.61 Mb

Хр. 17: 29.25 – 29.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRSF3 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 164 амінокислот, а молекулярна маса — 19 330^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRDSCPLDC	KVYVGNLGNN	GNKTELERAF	GYYGPLRSVW	VARNPPGFAF
VEFEDPRDAA	DAVRELDGRT	LCGCRVRVEL	SNGEKRSRNR	GPPPSWGRRP
RDDYRRRSPP	PRRRSPRRRS	FSRSRSRSLS	RDRRRERSLS	RERNHKPSRS
FSRSRSRSRS	NERK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Barnard D.C., Patton J.G. (2000). Identification and characterization of a novel serine-arginine-rich splicing regulatory protein. Mol. Cell. Biol. 20: 3049—3057. PMID 10757789 DOI:10.1128/MCB.20.9.3049-3057.2000
Huang Y., Steitz J.A. (2001). Splicing factors SRp20 and 9G8 promote the nucleocytoplasmic export of mRNA. Mol. Cell. 7: 899—905. PMID 11336712 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00233-7
Huang Y., Gattoni R., Stevenin J., Steitz J.A. (2003). SR splicing factors serve as adapter proteins for TAP-dependent mRNA export. Mol. Cell. 11: 837—843. PMID 12667464 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00089-3
Elliott D.J. (2004). The role of potential splicing factors including RBMY, RBMX, hnRNPG-T and STAR proteins in spermatogenesis. Int. J. Androl. 27: 328—334. PMID 15595951 DOI:10.1111/j.1365-2605.2004.00496.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10785 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P84103 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.