SSBP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1S3O, 2DUD, 3ULL

Ідентифікатори

Символи

SSBP1, Mt-SSB, SOSS-B1, SSBP, mtSSB, single stranded DNA binding protein 1, OPA13

Зовнішні ІД

OMIM: 600439 MGI: 1920040 HomoloGene: 74462 GeneCards: SSBP1

Пов'язані генетичні захворювання

optic atrophy with negative Electroretinograms^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • single-stranded DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• мітохондріальний матрикс • mitochondrial nucleoid • екзосома • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоїд
Біологічний процес	• реплікація ДНК • mitochondrion organization • mitochondrion morphogenesis • positive regulation of helicase activity • mitochondrial DNA replication
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6742


381760

Ensembl


ENSG00000262771 ENSG00000106028


ENSMUSG00000029911

UniProt


Q04837


Q9CYR0

RefSeq (мРНК)


NM_001256510 NM_001256511 NM_001256512 NM_001256513 NM_003143


NM_001286663 NM_028358 NM_212468 NM_001364578

RefSeq (білок)


NP_001243439 NP_001243440 NP_001243441 NP_001243442 NP_003134


NP_001273592 NP_082634 NP_997633 NP_001351507

Локус (UCSC)

Хр. 7: 141.74 – 141.79 Mb

Хр. 6: 40.45 – 40.46 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSBP1 (англ. Single stranded DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 17 260^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRRPVLQVL	RQFVRHESET	TTSLVLERSL	NRVHLLGRVG	QDPVLRQVEG
KNPVTIFSLA	TNEMWRSGDS	EVYQLGDVSQ	KTTWHRISVF	RPGLRDVAYQ
YVKKGSRIYL	EGKIDYGEYM	DKNNVRRQAT	TIIADNIIFL	SDQTKEKE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

Tiranti V., Rocchi M., Didonato S., Zeviani M. (1993). Cloning of human and rat cDNAs encoding the mitochondrial single-stranded DNA-binding protein (SSB). Gene. 126: 219—225. PMID 8482537 DOI:10.1016/0378-1119(93)90370-I
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310—19315. PMID 19892738 DOI:10.1073/pnas.0908958106
Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
van Loon B., Samson L.D. (2013). Alkyladenine DNA glycosylase (AAG) localizes to mitochondria and interacts with mitochondrial single-stranded binding protein (mtSSB). DNA Repair. 12: 177—187. PMID 23290262 DOI:10.1016/j.dnarep.2012.11.009
Yang C., Curth U., Urbanke C., Kang C. (1997). Crystal structure of human mitochondrial single-stranded DNA binding protein at 2.4-A resolution. Nat. Struct. Biol. 4: 153—157. PMID 9033597 DOI:10.1038/nsb0297-153

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SSBP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11317 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
↑ UniProt, Q04837 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.