SSBP4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SSBP4

Ідентифікатори

Символи

SSBP4, single stranded DNA binding protein 4

Зовнішні ІД

OMIM: 607391 MGI: 1924150 HomoloGene: 41881 GeneCards: SSBP4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


170463


76900

Ensembl


ENSG00000130511


ENSMUSG00000070003

UniProt


Q9BWG4


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001009998 NM_032627


NM_133772

RefSeq (білок)


NP_001009998 NP_116016


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 18.42 – 18.43 Mb

Хр. 8: 70.6 – 70.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSBP4 (англ. Single stranded DNA binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 39 388^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYAKGGKGSA	VPSDSQAREK	LALYVYEYLL	HIGAQKSAQT	FLSEIRWEKN
ITLGEPPGFL	HSWWCVFWDL	YCAAPDRREA	CEHSGEAKAF	QDYSAAAAPS
PVMGSMAPGD	TMAAGSMAAG	FFQGPPGSQP	SPHNPNAPMM	GPHGQPFMSP
RFPGGPRPTL	RMPSQPPAGL	PGSQPLLPGA	MEPSPRAQGH	PSMGGPMQRV
TPPRGMASVG	PQSYGGGMRP	PPNSLAGPGL	PAMNMGPGVR	GPWASPSGNS
IPYSSSSPGS	YTGPPGGGGP	PGTPIMPSPG	DSTNSSENMY	TIMNPIGQGA
GRANFPLGPG	PEGPMAAMSA	MEPHHVNGSL	GSGDMDGLPK	SSPGAVAGLS
NAPGTPRDDG	EMAAAGTFLH	PFPSESYSPG	MTMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15676 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BWG4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 21 вересня 2017.