SSR1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SSR1, TRAPA, signal sequence receptor subunit 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600868 MGI: 105082 HomoloGene: 2368 GeneCards: SSR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум |
---|
Біологічний процес | • IRE1-mediated unfolded protein response • cotranslational protein targeting to membrane • positive regulation of cell population proliferation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/ad/PBB_GE_SSR1_200889_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSR1_200889_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e6/PBB_GE_SSR1_201894_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSR1_201894_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/40/PBB_GE_SSR1_200891_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSR1_200891_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 7.27 – 7.35 Mb | Хр. 13: 38.15 – 38.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SSR1 (англ. Signal sequence receptor subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 32 235[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRLLPRLLLL | | LLLVFPATVL | | FRGGPRGLLA | | VAQDLTEDEE | | TVEDSIIEDE |
DDEAEVEEDE | | PTDLVEDKEE | | EDVSGEPEAS | | PSADTTILFV | | KGEDFPANNI |
VKFLVGFTNK | | GTEDFIVESL | | DASFRYPQDY | | QFYIQNFTAL | | PLNTVVPPQR |
QATFEYSFIP | | AEPMGGRPFG | | LVINLNYKDL | | NGNVFQDAVF | | NQTVTVIERE |
DGLDGETIFM | | YMFLAGLGLL | | VIVGLHQLLE | | SRKRKRPIQK | | VEMGTSSQND |
VDMSWIPQET | | LNQINKASPR | | RLPRKRAQKR | | SVGSDE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Hartmann E., Prehn S. (1994). The N-terminal region of the alpha-subunit of the TRAP complex has a conserved cluster of negative charges. FEBS Lett. 349: 324—326. PMID 8050590 DOI:10.1016/0014-5793(94)00693-8
- Hirama T., Miller C.W., Koeffler H.P. (1999). Translocon-associated protein alpha transcripts are induced by granulocyte-macrophage colony-stimulating factor and exhibit complex alternative polyadenylation. FEBS Lett. 455: 223—227. PMID 10437777 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00885-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wei M.L., Cresswell P. (1992). HLA-A2 molecules in an antigen-processing mutant cell contain signal sequence-derived peptides. Nature. 356: 443—446. PMID 1557127 DOI:10.1038/356443a0
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11323 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P43307 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |