SSR1

Ідентифікатори

Символи

SSR1, TRAPA, signal sequence receptor subunit 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600868 MGI: 105082 HomoloGene: 2368 GeneCards: SSR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• IRE1-mediated unfolded protein response • cotranslational protein targeting to membrane • positive regulation of cell population proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6745


107513

Ensembl


ENSG00000124783


ENSMUSG00000021427

UniProt


P43307


Q9CY50

RefSeq (мРНК)


NM_001292008 NM_003144


NM_025965 NM_001360842

RefSeq (білок)


NP_001278937 NP_003135


NP_080241 NP_001347771

Локус (UCSC)

Хр. 6: 7.27 – 7.35 Mb

Хр. 13: 38.15 – 38.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSR1 (англ. Signal sequence receptor subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 32 235^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLPRLLLL	LLLVFPATVL	FRGGPRGLLA	VAQDLTEDEE	TVEDSIIEDE
DDEAEVEEDE	PTDLVEDKEE	EDVSGEPEAS	PSADTTILFV	KGEDFPANNI
VKFLVGFTNK	GTEDFIVESL	DASFRYPQDY	QFYIQNFTAL	PLNTVVPPQR
QATFEYSFIP	AEPMGGRPFG	LVINLNYKDL	NGNVFQDAVF	NQTVTVIERE
DGLDGETIFM	YMFLAGLGLL	VIVGLHQLLE	SRKRKRPIQK	VEMGTSSQND
VDMSWIPQET	LNQINKASPR	RLPRKRAQKR	SVGSDE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Hartmann E., Prehn S. (1994). The N-terminal region of the alpha-subunit of the TRAP complex has a conserved cluster of negative charges. FEBS Lett. 349: 324—326. PMID 8050590 DOI:10.1016/0014-5793(94)00693-8
Hirama T., Miller C.W., Koeffler H.P. (1999). Translocon-associated protein alpha transcripts are induced by granulocyte-macrophage colony-stimulating factor and exhibit complex alternative polyadenylation. FEBS Lett. 455: 223—227. PMID 10437777 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00885-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wei M.L., Cresswell P. (1992). HLA-A2 molecules in an antigen-processing mutant cell contain signal sequence-derived peptides. Nature. 356: 443—446. PMID 1557127 DOI:10.1038/356443a0
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11323 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P43307 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.