SSX2IP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SSX2IP, ADIP, synovial sarcoma, X breakpoint 2 interacting protein, SSX family member 2 interacting protein, hMsd1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608690 MGI: 2139150 HomoloGene: 8522 GeneCards: SSX2IP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • Адгезивні контакти • міжклітинні контакти • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • клітинне ядро • ciliary basal body • centriolar satellite • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of cell motility • intraciliary transport involved in cilium assembly • regulation of Rac protein signal transduction • адгезія клітин • cell projection organization • cilium assembly • centrosome cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fb/PBB_GE_SSX2IP_203016_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSX2IP_203016_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/dd/PBB_GE_SSX2IP_203017_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSX2IP_203017_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d2/PBB_GE_SSX2IP_203015_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SSX2IP_203015_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001166293 NM_001166294 NM_001166295 NM_001166417 NM_014021 |
| | NM_001253768 NM_001253769 NM_001253770 NM_138744 NM_001355661 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001159765 NP_001159766 NP_001159767 NP_001159889 NP_054740 |
| | NP_001240697 NP_001240698 NP_001240699 NP_620083 NP_001342590 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 84.64 – 84.69 Mb | Хр. 3: 146.11 – 146.15 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SSX2IP (англ. SSX family member 2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 71 236[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGDWMTVTDP | | GLSSESKTIS | | QYTSETKMSP | | SSLYSQQVLC | | SSIPLSKNVH |
SFFSAFCTED | | NIEQSISYLD | | QELTTFGFPS | | LYEESKGKET | | KRELNIVAVL |
NCMNELLVLQ | | RKNLLAQENV | | ETQNLKLGSD | | MDHLQSCYSK | | LKEQLETSRR |
EMIGLQERDR | | QLQCKNRNLH | | QLLKNEKDEV | | QKLQNIIASR | | ATQYNHDMKR |
KEREYNKLKE | | RLHQLVMNKK | | DKKIAMDILN | | YVGRADGKRG | | SWRTGKTEAR |
NEDEMYKILL | | NDYEYRQKQI | | LMENAELKKV | | LQQMKKEMIS | | LLSPQKKKPR |
ERVDDSTGTV | | ISDVEEDAGE | | LSRESMWDLS | | CETVREQLTN | | SIRKQWRILK |
SHVEKLDNQV | | SKVHLEGFND | | EDVISRQDHE | | QETEKLELEI | | QQCKEMIKTQ |
QQLLQQQLAT | | AYDDDTTSLL | | RDCYLLEEKE | | RLKEEWSLFK | | EQKKNFERER |
RSFTEAAIRL | | GLERKAFEEE | | RASWLKQQFL | | NMTTFDHQNS | | ENVKLFSAFS |
GSSDWDNLIV | | HSRQPQKKPH | | SVSNGSPVCM | | SKLTKSLPAS | | PSTSDFCQTR |
SCISEHSSIN | | VLNITAEEIK | | PNQVGGECTN | | QKWSVASRPG | | SQEGCYSGCS |
LSYTNSHVEK | | DDLP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, біогенез та деградація війок, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Guinn B., Greiner J., Schmitt M., Mills K.I. (2009). Elevated expression of the leukemia-associated antigen SSX2IP predicts survival in acute myeloid leukemia patients who lack detectable cytogenetic rearrangements. Blood. 113: 1203—1204. PMID 19179477 DOI:10.1182/blood-2008-09-178848
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16509 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2D8 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |