SSX2IP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG

Ідентифікатори

Символи

SSX2IP, ADIP, synovial sarcoma, X breakpoint 2 interacting protein, SSX family member 2 interacting protein, hMsd1

Зовнішні ІД

OMIM: 608690 MGI: 2139150 HomoloGene: 8522 GeneCards: SSX2IP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центр організації мікротрубочок • Адгезивні контакти • міжклітинні контакти • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • клітинне ядро • ciliary basal body • centriolar satellite • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of cell motility • intraciliary transport involved in cilium assembly • regulation of Rac protein signal transduction • адгезія клітин • cell projection organization • cilium assembly • centrosome cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


117178


99167

Ensembl


ENSG00000117155


ENSMUSG00000036825

UniProt


Q9Y2D8


Q8VC66

RefSeq (мРНК)


NM_001166293 NM_001166294 NM_001166295 NM_001166417 NM_014021


NM_001253768 NM_001253769 NM_001253770 NM_138744 NM_001355661

RefSeq (білок)


NP_001159765 NP_001159766 NP_001159767 NP_001159889 NP_054740


NP_001240697 NP_001240698 NP_001240699 NP_620083 NP_001342590

Локус (UCSC)

Хр. 1: 84.64 – 84.69 Mb

Хр. 3: 146.11 – 146.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSX2IP (англ. SSX family member 2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 71 236^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDWMTVTDP	GLSSESKTIS	QYTSETKMSP	SSLYSQQVLC	SSIPLSKNVH
SFFSAFCTED	NIEQSISYLD	QELTTFGFPS	LYEESKGKET	KRELNIVAVL
NCMNELLVLQ	RKNLLAQENV	ETQNLKLGSD	MDHLQSCYSK	LKEQLETSRR
EMIGLQERDR	QLQCKNRNLH	QLLKNEKDEV	QKLQNIIASR	ATQYNHDMKR
KEREYNKLKE	RLHQLVMNKK	DKKIAMDILN	YVGRADGKRG	SWRTGKTEAR
NEDEMYKILL	NDYEYRQKQI	LMENAELKKV	LQQMKKEMIS	LLSPQKKKPR
ERVDDSTGTV	ISDVEEDAGE	LSRESMWDLS	CETVREQLTN	SIRKQWRILK
SHVEKLDNQV	SKVHLEGFND	EDVISRQDHE	QETEKLELEI	QQCKEMIKTQ
QQLLQQQLAT	AYDDDTTSLL	RDCYLLEEKE	RLKEEWSLFK	EQKKNFERER
RSFTEAAIRL	GLERKAFEEE	RASWLKQQFL	NMTTFDHQNS	ENVKLFSAFS
GSSDWDNLIV	HSRQPQKKPH	SVSNGSPVCM	SKLTKSLPAS	PSTSDFCQTR
SCISEHSSIN	VLNITAEEIK	PNQVGGECTN	QKWSVASRPG	SQEGCYSGCS
LSYTNSHVEK	DDLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, біогенез та деградація війок, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Guinn B., Greiner J., Schmitt M., Mills K.I. (2009). Elevated expression of the leukemia-associated antigen SSX2IP predicts survival in acute myeloid leukemia patients who lack detectable cytogenetic rearrangements. Blood. 113: 1203—1204. PMID 19179477 DOI:10.1182/blood-2008-09-178848

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16509 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2D8 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.