STAG1

Ідентифікатори

Символи

STAG1, SA1, SCC3A, stromal antigen 1, MRD47

Зовнішні ІД

OMIM: 604358 MGI: 1098658 HomoloGene: 21191 GeneCards: STAG1

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant mental retardation 47^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• хромосома • гіалоплазма • Хроматин • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0000798 cohesin complex • nuclear matrix • mitotic spindle pole
Біологічний процес	• chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of mitotic spindle assembly • sister chromatid cohesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10274


20842

Ensembl


ENSG00000118007


ENSMUSG00000037286

UniProt


Q8WVM7


Q9D3E6

RefSeq (мРНК)


NM_005862


NM_009282 NM_001357264 NM_001357265

RefSeq (білок)


NP_005853


NP_033308 NP_001344193 NP_001344194

Локус (UCSC)

Хр. 3: 136.34 – 136.75 Mb

Хр. 9: 100.48 – 100.84 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STAG1 (англ. Stromal antigen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 258 амінокислот, а молекулярна маса — 144 427^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MITSELPVLQ	DSTNETTAHS	DAGSELEETE	VKGKRKRGRP	GRPPSTNKKP
RKSPGEKSRI	EAGIRGAGRG	RANGHPQQNG	EGEPVTLFEV	VKLGKSAMQS
VVDDWIESYK	QDRDIALLDL	INFFIQCSGC	RGTVRIEMFR	NMQNAEIIRK
MTEEFDEDSG	DYPLTMPGPQ	WKKFRSNFCE	FIGVLIRQCQ	YSIIYDEYMM
DTVISLLTGL	SDSQVRAFRH	TSTLAAMKLM	TALVNVALNL	SIHQDNTQRQ
YEAERNKMIG	KRANERLELL	LQKRKELQEN	QDEIENMMNS	IFKGIFVHRY
RDAIAEIRAI	CIEEIGVWMK	MYSDAFLNDS	YLKYVGWTLH	DRQGEVRLKC
LKALQSLYTN	RELFPKLELF	TNRFKDRIVS	MTLDKEYDVA	VEAIRLVTLI
LHGSEEALSN	EDCENVYHLV	YSAHRPVAVA	AGEFLHKKLF	SRHDPQAEEA
LAKRRGRNSP	NGNLIRMLVL	FFLESELHEH	AAYLVDSLWE	SSQELLKDWE
CMTELLLEEP	VQGEEAMSDR	QESALIELMV	CTIRQAAEAH	PPVGRGTGKR
VLTAKERKTQ	IDDRNKLTEH	FIITLPMLLS	KYSADAEKVA	NLLQIPQYFD
LEIYSTGRME	KHLDALLKQI	KFVVEKHVES	DVLEACSKTY	SILCSEEYTI
QNRVDIARSQ	LIDEFVDRFN	HSVEDLLQEG	EEADDDDIYN	VLSTLKRLTS
FHNAHDLTKW	DLFGNCYRLL	KTGIEHGAMP	EQIVVQALQC	SHYSILWQLV
KITDGSPSKE	DLLVLRKTVK	SFLAVCQQCL	SNVNTPVKEQ	AFMLLCDLLM
IFSHQLMTGG	REGLQPLVFN	PDTGLQSELL	SFVMDHVFID	QDEENQSMEG
DEEDEANKIE	ALHKRRNLLA	AFSKLIIYDI	VDMHAAADIF	KHYMKYYNDY
GDIIKETLSK	TRQIDKIQCA	KTLILSLQQL	FNELVQEQGP	NLDRTSAHVS
GIKELARRFA	LTFGLDQIKT	REAVATLHKD	GIEFAFKYQN	QKGQEYPPPN
LAFLEVLSEF	SSKLLRQDKK	TVHSYLEKFL	TEQMMERRED	VWLPLISYRN
SLVTGGEDDR	MSVNSGSSSS	KTSSVRNKKG	RPPLHKKRVE	DESLDNTWLN
RTDTMIQTPG	PLPAPQLTST	VLRENSRPMG	DQIQEPESEH	GSEPDFLHNP
QMQISWLGQP	KLEDLNRKDR	TGMNYMKVRT	GVRHAVRGLM	EEDAEPIFED
VMMSSRSQLE	DMNEEFEDTM	VIDLPPSRNR	RERAELRPDF	FDSAAIIEDD
SGFGMPMF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STAG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11354 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8WVM7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.