STRBP |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/77/Protein_STRBP_PDB_2dmy.png/250px-Protein_STRBP_PDB_2dmy.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | STRBP, HEL162, ILF3L, SPNR, p74, spermatid perinuclear RNA binding protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611138 MGI: 104626 HomoloGene: 7548 GeneCards: STRBP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • microtubule binding • tubulin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • microtubule cytoskeleton • клітинне ядро • manchette |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • mechanosensory behavior • диференціація клітин • Сперматогенез • spermatid development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001171137 NM_018387 NM_001376106 NM_001376107 NM_001376109 |
| NM_009261 NM_176932 NM_001355259 NM_001379314 NM_001379315
| NM_001379316 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001164608 NP_060857 NP_001363035 NP_001363036 NP_001363038 |
| | NP_033287 NP_001342188 NP_001366243 NP_001366244 NP_001366245 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 123.11 – 123.27 Mb | Хр. 2: 37.37 – 37.59 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
STRBP (англ. Spermatid perinuclear RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 73 653[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRSIRSFAND | | DRHVMVKHST | | IYPSPEELEA | | VQNMVSTVEC | | ALKHVSDWLD |
ETNKGTKTEG | | ETEVKKDEAG | | ENYSKDQGGR | | TLCGVMRIGL | | VAKGLLIKDD |
MDLELVLMCK | | DKPTETLLNT | | VKDNLPIQIQ | | KLTEEKYQVE | | QCVNEASIII |
RNTKEPTLTL | | KVILTSPLIR | | DELEKKDGEN | | VSMKDPPDLL | | DRQKCLNALA |
SLRHAKWFQA | | RANGLKSCVI | | VLRILRDLCN | | RVPTWAPLKG | | WPLELICEKS |
IGTCNRPLGA | | GEALRRVMEC | | LASGILLPGG | | PGLHDPCERD | | PTDALSYMTI |
QQKEDITHSA | | QHALRLSAFG | | QIYKVLEMDP | | LPSSKPFQKY | | SWSVTDKEGA |
GSSALKRPFE | | DGLGDDKDPN | | KKMKRNLRKI | | LDSKAIDLMN | | ALMRLNQIRP |
GLQYKLLSQS | | GPVHAPVFTM | | SVDVDGTTYE | | ASGPSKKTAK | | LHVAVKVLQA |
MGYPTGFDAD | | IECMSSDEKS | | DNESKNETVS | | SNSSNNTGNS | | TTETSSTLEV |
RTQGPILTAS | | GKNPVMELNE | | KRRGLKYELI | | SETGGSHDKR | | FVMEVEVDGQ |
KFRGAGPNKK | | VAKASAALAA | | LEKLFSGPNA | | ANNKKKKIIP | | QAKGVVNTAV |
SAAVQAVRGR | | GRGTLTRGAF | | VGATAAPGYI | | APGYGTPYGY | | STAAPAYGLP |
KRMVLLPVMK | | FPTYPVPHYS | | FF |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16462 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96SI9 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |