STX17

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4WY4,%%s4WY4

Ідентифікатори

Символи

STX17, syntaxin 17

Зовнішні ІД

OMIM: 604204 MGI: 1914977 HomoloGene: 9917 GeneCards: STX17

Пов'язані генетичні захворювання

alopecia areata^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • protein kinase binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• HOPS complex • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane • rough endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • lysosomal membrane • autophagosome membrane • SNARE complex • smooth endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • ER to Golgi transport vesicle membrane • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • autophagosome • клітинна мембрана • система ендомембран
Біологічний процес	• endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment organization • Golgi organization • protein localization to phagophore assembly site • автофагія • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle docking • GO:0000046 autophagosome maturation • intracellular protein transport • vesicle fusion • vesicle-mediated transport • autophagosome membrane docking • екзоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55014


67727

Ensembl


ENSG00000136874


ENSMUSG00000061455

UniProt


P56962


Q9D0I4

RefSeq (мРНК)


NM_017919


NM_026343

RefSeq (білок)


NP_060389


NP_080619

Локус (UCSC)

Хр. 9: 99.91 – 99.97 Mb

Хр. 4: 48.12 – 48.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STX17 (англ. Syntaxin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 302 амінокислот, а молекулярна маса — 33 403^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEDEEKVKL	RRLEPAIQKF	IKIVIPTDLE	RLRKHQINIE	KYQRCRIWDK
LHEEHINAGR	TVQQLRSNIR	EIEKLCLKVR	KDDLVLLKRM	IDPVKEEASA
ATAEFLQLHL	ESVEELKKQF	NDEETLLQPP	LTRSMTVGGA	FHTTEAEASS
QSLTQIYALP	EIPQDQNAAE	SWETLEADLI	ELSQLVTDFS	LLVNSQQEKI
DSIADHVNSA	AVNVEEGTKN	LGKAAKYKLA	ALPVAGALIG	GMVGGPIGLL
AGFKVAGIAA	ALGGGVLGFT	GGKLIQRKKQ	KMMEKLTSSC	PDLPSQTDKK
CS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, автофагія, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Muppirala M., Gupta V., Swarup G. (2011). Syntaxin 17 cycles between the ER and ERGIC and is required to maintain the architecture of ERGIC and Golgi. Biol. Cell. 103: 333—350. PMID 21545355 DOI:10.1042/BC20110006
Muppirala M., Gupta V., Swarup G. (2012). Tyrosine phosphorylation of a SNARE protein, Syntaxin 17: Implications for membrane trafficking in the early secretory pathway. Biochim. Biophys. Acta. 1823: 2109—2119. PMID 23006999 DOI:10.1016/j.bbamcr.2012.09.003
Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STX17 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11432 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P56962 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.