SUB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1PCF, 2C62, 2PHE, 4USG

Ідентифікатори

Символи

SUB1, P15, PC4, p14, SUB1 homolog, transcriptional regulator, SUB1 regulator of transcription

Зовнішні ІД

OMIM: 600503 MGI: 104811 HomoloGene: 38218 GeneCards: SUB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • екзосома • transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • SMAD protein signal transduction • transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10923


20024

Ensembl


ENSG00000113387


ENSMUSG00000022205

UniProt


P53999


P11031

RefSeq (мРНК)


NM_006713


NM_011294

RefSeq (білок)


NP_006704


NP_035424

Локус (UCSC)

Хр. 5: 32.53 – 32.6 Mb

Хр. 15: 11.98 – 12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SUB1 (англ. SUB1 homolog, transcriptional regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 127 амінокислот, а молекулярна маса — 14 395^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKSKELVSS	SSSGSDSDSE	VDKKLKRKKQ	VAPEKPVKKQ	KTGETSRALS
SSKQSSSSRD	DNMFQIGKMR	YVSVRDFKGK	VLIDIREYWM	DPEGEMKPGR
KGISLNPEQW	SQLKEQISDI	DDAVRKL

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kretzschmar M., Kaiser K., Lottspeich F., Meisterernst M. (1994). A novel mediator of class II gene transcription with homology to viral immediate-early transcriptional regulators. Cell. 78: 525—534. PMID 8062392 DOI:10.1016/0092-8674(94)90429-4
Ge H., Roeder R.G. (1994). Purification, cloning, and characterization of a human coactivator, PC4, that mediates transcriptional activation of class II genes. Cell. 78: 513—523. PMID 8062391 DOI:10.1016/0092-8674(94)90428-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ge H., Zhao Y., Chait B.T., Roeder R.G. (1994). Phosphorylation negatively regulates the function of coactivator PC4. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 12691—12695. PMID 7809103 DOI:10.1073/pnas.91.26.12691
Malik S., Guermah M., Roeder R.G. (1998). A dynamic model for PC4 coactivator function in RNA polymerase II transcription. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 2192—2197. PMID 9482861 DOI:10.1073/pnas.95.5.2192
Calvo O., Manley J.L. (2001). Evolutionarily conserved interaction between CstF-64 and PC4 links transcription, polyadenylation, and termination. Mol. Cell. 7: 1013—1023. PMID 11389848 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00236-2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19985 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P53999 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.