SYCP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4YTO

Ідентифікатори

Символи

SYCP1, CT8, HOM-TES-14, SCP-1, SCP1, synaptonemal complex protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602162 MGI: 105931 HomoloGene: 2389 GeneCards: SYCP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • double-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• condensed nuclear chromosome • central element • male germ cell nucleus • хромосома • transverse filament • клітинне ядро • synaptonemal complex • центромера
Біологічний процес	• lateral element assembly • Сперматогенез • GO:0007126 мейоз • GO:0035093 sperm DNA condensation • regulation of protein localization • meiotic DNA repair synthesis • chiasma assembly • поділ клітини • клітинний цикл • synaptonemal complex assembly • homologous chromosome pairing at meiosis • reciprocal meiotic recombination • protein homotetramerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6847


20957

Ensembl


ENSG00000198765


ENSMUSG00000027855

UniProt


Q15431


Q62209

RefSeq (мРНК)


NM_001282541 NM_001282542 NM_003176


NM_011516

RefSeq (білок)


NP_001269470 NP_001269471 NP_003167 NP_001269470.1 NP_003167.2


NP_035646

Локус (UCSC)

Хр. 1: 114.85 – 115 Mb

Хр. 3: 102.73 – 102.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYCP1 (англ. Synaptonemal complex protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 976 амінокислот, а молекулярна маса — 114 192^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKQKPFALF	VPPRSSSSQV	SAVKPQTLGG	DSTFFKSFNK	CTEDDFEFPF
AKTNLSKNGE	NIDSDPALQK	VNFLPVLEQV	GNSDCHYQEG	LKDSDLENSE
GLSRVYSKLY	KEAEKIKKWK	VSTEAELRQK	ESKLQENRKI	IEAQRKAIQE
LQFGNEKVSL	KLEEGIQENK	DLIKENNATR	HLCNLLKETC	ARSAEKTKKY
EYEREETRQV	YMDLNNNIEK	MITAFEELRV	QAENSRLEMH	FKLKEDYEKI
QHLEQEYKKE	INDKEKQVSL	LLIQITEKEN	KMKDLTFLLE	ESRDKVNQLE
EKTKLQSENL	KQSIEKQHHL	TKELEDIKVS	LQRSVSTQKA	LEEDLQIATK
TICQLTEEKE	TQMEESNKAR	AAHSFVVTEF	ETTVCSLEEL	LRTEQQRLEK
NEDQLKILTM	ELQKKSSELE	EMTKLTNNKE	VELEELKKVL	GEKETLLYEN
KQFEKIAEEL	KGTEQELIGL	LQAREKEVHD	LEIQLTAITT	SEQYYSKEVK
DLKTELENEK	LKNTELTSHC	NKLSLENKEL	TQETSDMTLE	LKNQQEDINN
NKKQEERMLK	QIENLQETET	QLRNELEYVR	EELKQKRDEV	KCKLDKSEEN
CNNLRKQVEN	KNKYIEELQQ	ENKALKKKGT	AESKQLNVYE	IKVNKLELEL
ESAKQKFGEI	TDTYQKEIED	KKISEENLLE	EVEKAKVIAD	EAVKLQKEID
KRCQHKIAEM	VALMEKHKHQ	YDKIIEERDS	ELGLYKSKEQ	EQSSLRASLE
IELSNLKAEL	LSVKKQLEIE	REEKEKLKRE	AKENTATLKE	KKDKKTQTFL
LETPEIYWKL	DSKAVPSQTV	SRNFTSVDHG	ISKDKRDYLW	TSAKNTLSTP
LPKAYTVKTP	TKPKLQQREN	LNIPIEESKK	KRKMAFEFDI	NSDSSETTDL
LSMVSEEETL	KTLYRNNNPP	ASHLCVKTPK	KAPSSLTTPG	STLKFGAIRK
MREDRWAVIA	KMDRKKKLKE	AEKLFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мейоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

Meuwissen R.L.J., Meerts I., Hoovers J.M.N., Leschot N.J., Heyting C. (1997). Human synaptonemal complex protein 1 (SCP1): isolation and characterization of the cDNA and chromosomal localization of the gene. Genomics. 39: 377—384. PMID 9119375 DOI:10.1006/geno.1996.4373
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Park H.H. (2015). X-ray crystallographic studies of the middle part of the human synaptonemal complex protein 1 coiled-coil domain. Acta Crystallogr. F. 71: 1131—1134. PMID 26323297 DOI:10.1107/S2053230X15012728

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11487 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15431 (англ.) . Архів оригіналу за 20 лютого 2017. Процитовано 25 серпня 2017.