SYNPR

Ідентифікатори

Символи

SYNPR, SPO, synaptoporin

Зовнішні ІД

MGI: 1919253 HomoloGene: 11407 GeneCards: SYNPR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin-1 binding
Клітинна компонента	• синапс • мембрана • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of synaptic vesicle membrane • synaptic vesicle membrane • neuron projection • integral component of membrane • Синаптичні бульбашки
Біологічний процес	• GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


132204


72003

Ensembl


ENSG00000163630


ENSMUSG00000056296

UniProt


Q8TBG9


Q8BGN8

RefSeq (мРНК)


NM_001130003 NM_144642


NM_001163032 NM_028052

RefSeq (білок)


NP_001123475 NP_653243


NP_001156504 NP_082328

Локус (UCSC)

Хр. 3: 63.23 – 63.62 Mb

Хр. 14: 8.85 – 9.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYNPR (англ. Synaptoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 265 амінокислот, а молекулярна маса — 29 166^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCMVIFAPLF	AIFAFATCGG	YSGGLRLSVD	CVNKTESNLS	IDIAFAYPFR
LHQVTFEVPT	CEGKERQKLA	LIGDSSSSAE	FFVTVAVFAF	LYSLAATVVY
IFFQNKYREN	NRGPLIDFIV	TVVFSFLWLV	GSSAWAKGLS	DVKVATDPKE
VLLLMSACKQ	PSNKCMAIHS	PVMSSLNTSV	VFGFLNFILW	AGNIWFVFKE
TGWHSSGQRY	LSDPMEKHSS	SYNQGGYNQD	SYGSSSGYSQ	QASLGPTSDE
FGQQPTGPTS	FTNQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16507 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TBG9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.